中遵循以下基本原则本规程编写格式应符合标准化工作导则第部分标准的结构和编写规则的要求本规程规定的技术内容及要求应科学合理，具有适用性和可操作性本标准的水平应达到国内领先水平。

畜禽基因组选择育种技术规程征求意见稿编制说明。

年，澳大利亚利用头头安格斯牛，头短脚牛，头海福特牛，头默里牛，头婆罗门牛和杂交品种进行个性状的多品种基因组选择研究，所有牛的基因型全部填充至高密度芯了万头优良后代母牛。

国内外研究概况自年提出全基因组选择的概念和方法后，基因组选择广受动植物育种界的关注，它是利用高密度芯片获取基因组范围内的标记信息，对目标性状进行遗传评估并进行选择的策略，。

此概念经提出立刻得到遗传育种学家的积极响应，各国的科学家们围绕的算法如何提高的估计准确度以及如何将其应用到具体的育种实践和传统方法另外，当标记密度从增加至时，基因组育种值准确性并未提高，因此，对于法国夏洛莱群体来说，利用方法并利用逆回归育种值，当因变量可以获得更高的准确性，。

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年起，加拿大奶业网，开始公布荷斯坦牛基因组遗传评估结果。

截止至年，包括个品种荷斯坦牛娟姗牛瑞士褐牛和爱尔夏牛的公母牛在内，数据库中有基因型的个体数已达百万。

各品种青年公牛的市场占有率均达到以上，其中荷斯坦牛和娟姗牛超过了。

终生效益指数获得基因型，同样利用方法评估基因组育种值的准确性，结果表明在利木赞群体中基因组育种值估计的准确性之间，在西门塔尔群体中基因组育种值估计的准确性之间，。

年，美国利用多个商用肉牛群体进行基因组选择研究，其中包括安格斯头，夏洛莱头，海福特头，利木赞头和西门塔尔头，所有牛全部利用获得基因型，研究用个性状剪切力，眼肌面积，大理石评分，背膘厚，胴体重和产肉等级比较不同贝叶斯模型下基因组育种值估计的准确性，结果表明假设效应方差不同的混合和模型优于模型。

但对于大部分性状来讲，种贝叶斯模型估计的准确性相似，表明大部分性状是由微效多畜禽基因组选择育种技术规程征求意见稿编制说明单品种的评估可以显著提高基因组育种值估计的准确性，。

年，澳大利亚利用头，和杂交品种进行基因组选择中的非加性效应研究，所有牛全部填充至的高密度芯片，显性方差是由个构建的显性方差矩阵，结果表明，各性状间的显性方差变化很大，个性状间的平均显性方差占表型方差的，模型中加入显性效应不能显著提高基因组育种值估计的准确性，但显性效应模型可能是未来研究的个方向，。

年，加拿大利用多头多个品种肉牛群体进行个胴体性状和个肉质性状的基因组选择研究，分析不同标记密度和是否可以引起育种值估计准确性较大差异，结果证明，低密度芯片可以获得如何提高的估计准确度以及如何将其应用到具体的育种实践，中展开了多方面的探讨和研究，使选择理论和技术体系日趋完善。

在对基因组选择理论研究的同时，些国家努力将基因组选择应用于育种实践，。

由于表型测量方法参考群体及畜禽育种方法的差异，导致不同畜禽品种应用基因组选择取得的育种成效也有所差别。

基因组选择最先应用于奶牛和肉牛育种，随后逐渐在猪和羊的育种中应用。

在奶牛上的应用效果明显，显著地缩短了世代间隔，使美国奶牛生产性状的遗传进展每年提高方法并利用逆回归育种值，当因变量可以获得更高的准确性，。

年，澳大利亚利用头头安格斯牛，头短脚牛，头海福特牛，头默里牛，头婆罗门牛和杂交品种进行个性状的多品种基因组选择研究，所有牛的基因型全部填充至高密度芯片，结果表明，利用不同方法分别估计个性状的基因组育种值准确性有所不同，其中遗传力较高的性状和表型数据完善的性状基因组育种值估计的准确性较高，利用方法估计个性状的育种值准确性的平均值为另外，对于有显著的性状，方法比方法高出个百分点多品种的遗传评估相对叶斯岭回归，和，结果表明，和方法评估的准确性相同，并且随着遗传力的增加，基因组育种值估计的准确性增大，贝叶斯岭回归估计个性状背膘厚，胴体重和眼肌面积的准确性分别为，和，。

我国肉牛基因组选择已初步建立了肉牛全基因组选择技术体系，在内蒙古自治区锡林郭勒盟乌拉盖管理区建立肉牛遗传资源群体，到年初，基础母牛头，记录了体尺性状生长性状肉质性状等多个，并获得了每个体的进行基因型数据建立了和牛资源群体，群体规模头。

针对肉牛重要经济性状日增重断奶重宰前活重胴体重零售肉重屠宰率和净肉率性状，进行基因组选择倍交叉验证和倍交叉验模型中加入显性效应不能显著提高基因组育种值估计的准确性，但显性效应模型可能是未来研究的个方向，。

年，加拿大利用多头多个品种肉牛群体进行个胴体性状和个肉质性状的基因组选择研究，分析不同标记密度和是否可以引起育种值估计准确性较大差异，结果证明，低密度芯片可以获得较高的准确性，并可应用于肉牛基因组选择，。

年，加拿大利用头安格斯和头夏洛莱进行胴体性状的基因组育种值估计，结果表明利用年龄划分参考群体和验证群体比利用亲缘关系进行分组可以获得更高的育种值估计准确性，说明参考群体和验证群体的划分方法比使用芯片的标记密度更重要，。

年，巴西利用头内洛尔牛的个生长和胴体对比研究，倍交叉验证要优于倍交叉验证，育种值估计的准确性在之间，同时编制了肉牛基因组选择及多品种评估计算机程序，现正在逐步运用到肉牛新品系的选育上。

国内外研究概况自年提出全基因组选择的概念和方法后，基因组选择广受动植物育种界的关注，它是利用高密度芯片获取基因组范围内的标记信息，对目标性状进行遗传评估并进行选择的策略，。

此概念经提出立刻得到遗传育种学家的积极响应，各国的科学家们围绕的算法，本规程的制定，将有效规范基因组选择技术操作，并建立标准化的基因组选择技术的流程。

对加快基因组选择技术在畜禽育种中的应用，推进我国畜牧业的可持续发展和实现良种国产化具有重要意义。

标准制定原则规程在制定中遵循以下基本原则本规程编写格式应符合标准化工作导则第部分标准的结构和编写规则的要求本规程规定的技术内容及要求应科学合理，具有适用性和可操作性本标准的水平应达到国内领先水平。

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年，澳大利亚利用头头安格斯牛，头短脚牛，头海福特牛，头默里牛，头婆罗门牛和杂交品种进行个性状的多品种基因组选择研究，所有牛的基因型全部填充至高密度芯鸡等动物的标准化基因组选择技术流程，为基因组选择育种技术的实施提供操作规程。

基因组选择技术已成为动物育种的关键前沿技术，它突破了对候选种畜禽从表型选择到基因组选择的难题，解决了畜禽肉质和抗性等性状难以选育的障碍，提高了遗传评定的准确性和预见性，实现了低成本早期选择。

目前我国重要畜禽的基因组选择技术研究已越来越成熟，但尚未制定相应的技术规程，限制了该技术在育种实践中的推广应用。

主要工作过程接到任务后，对标准内容进行细分，明确每部分内容目标责任人撰写计划及完成时间。

查阅关于动物基因组选择育种相关方法法律法规和标准等文献专著，进行归纳整理。

国家标准畜禽基因组选择育种技术规程编制说明征求意见稿任务来源本国家标准的制定任务列入方法均高于方法，但是这两种贝叶斯方法估计的基因组育种值偏低基因组育种值和育种值的回归系数大于，。

年，巴西利用来自于头种公牛的头内洛尔牛进行胴体性状的基因组育种值估计，所有内洛尔牛全部利用获得基因型，利用倍交叉验证评估种贝叶斯方法的基因组育种值估计的准确性，包括贝叶斯岭回归，和，结果表明，和方法评估的准确性相同，并且随着遗传力的增加，基因组育种值估计的准确性增大，贝叶斯岭回归估计个性状背膘厚，胴体重和眼肌面积的准确性分别为，和，。

我国肉牛基因组选择已，。

而对于肉牛基因组选择，也有部分国家正在积极研究与应用，例如，年美国利用头安格斯牛的个表型性状个生长性状，个繁殖性状，个胴体性状进行基因组选择研究，该群体中个体均利用获得基因型，研究利用进行交叉验证评估基因组育种值估计的准确性，该方法可以增加组内的遗传关系，同时缩小组间的遗传关系，结果表明准确性在之间，平均基因组育种值估计的准确性为，。

年美国利用头利木赞和头西门塔尔牛的个性状个生长性状，个繁殖性状和个胴体和肉质性状进行基因组选择研究，该群体大部分牛利用获得基因型，仅有头西门塔尔利用对比研究，倍交叉验证要优于倍交叉验证，育种值估计的准确性在之间，同时编制了肉牛基因组选择及多品种评估计算机程序，现正在逐步运用到肉牛新品系的选育上。

国内外研究概况自年提出全基因组选择的概念和方法后，基因组选择广受动植物育种界的关注，它是利用高密度芯片获取基因组范围内的标记信息，对目标性状进行遗传评估并进行选择的策略，。

此概念经提出立刻得到遗传育种学家的积极响应，各国的科学家们围绕的算法，单品种的评估可以显著提高基因组育种值估计的准确性，。

年，澳大利亚利用头，和杂交品种进行基因组选择中的非加性效应研究，所有牛全部填充至的高密度芯片，显性方差是由个构建的显性方差矩阵，结果表明，各性状间的显性方差变化很大，个性状间的平均显性方差占表型方差的，模型中加入显性效应不能显著提高基因组育种值估计的准确性，但显性效应模型可能是未来研究的个方向，。

年，加拿大利用多头多个品种肉牛群体进行个胴体性状和个肉质性状的基因组选择研究，分析不同标记密度和是否可以引起育种值估计准确性较大差异，结果证明，低密度芯片可以获得时评估固定效应尤其是群体结构对估计准确性的影响，计算结果是模型的准确性最高，模型的偏差最小，在模型中加入群体结构的固定效应可以降低基因组育种值估计的准确性同时增大预测偏差，。

年，法国利用头夏洛莱的出生重断奶重肌肉发达度产犊难易度和骨胳发育度进行基因组育种值估计，所有牛全部利用获得基因型，研究比较不同统计方法不同参考群体和不同芯片密度对基因组育种值评估准确性的影响，结果表明，方法的准确性高于和传统方法另外，当标记密度从增加至时，基因组