doc 探究猪繁殖与呼吸综合征病毒基因的变异情况(病毒学论文) ㊣ 精品文档 值得下载

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年来出现的为代表的分支。


如图所示,株与华南地区近年新出现的重组毒,张世亨,等株的全基因序列测定及遗传进化分析中国兽医学报,于林洋,董建国,张乐宜,等猪繁殖与呼吸系统综合征病毒华南株的分离鉴定及遗传进化分析广东农业科学,张驰,董建国,于林洋,王爽云,范兰兰,张乐宜,刘燕玲,王磊,宋长绪猪繁殖与呼吸综合征病毒华南株全基因组测序与遗传进化分析畜牧与兽医,基金国家重点研发计划十农村领域国家科技计划项目年乡村振兴战略专项构建现代农业体系重大动物疫病防控技术研究和推广项目广东省重点领域研发计划项目非洲猪瘟应急综合防控技术研究及应用广东省畜禽地方品种保护与研发利用提升工程。


年月,本实验室从广东省江门市发病猪场采集肺构建进化树分析。


全基因组分析中与同源性最高,为。


是最大的非结构蛋白,容易发生缺失和突变,基因长度约为。


毒株氨基酸序列比对结果与高致病性毒株和高致病疫苗株相似,在位存在个不连续氨基酸的缺失,符合高致病性毒株特点。


美洲型毒株蛋白的表位有个,和为非中和表位,为中和表位。


与美洲型代表毒株相比,在非中和表位中有个的变异在位有突变,该突变与高致病性毒株及其疫苗株相同在位有突变,该突变与经典毒株和高致病性毒株及其疫苗株相同。


中和表位中,在位有个突变,该突变与高致病性毒株及其疫苗株相同。


探究猪繁殖与呼吸综合征病毒基因的变异情况病毒学论文在个不连续氨基酸的缺失,此外在位存在突变。


运用软件对和国内外参考毒株进行氨基酸序列比对图。


在位有变异在位有突变在位有突变在位有个突变。


此外还存在多个突变位点,在位存在突变,位有突变,位有突变,位有突变。


图氨基酸序列比对结果方框中为核苷酸变异位点,下同图氨基酸序列比对结果全基因重组部位特征分析运用软件将株与高致病性毒株和近年来华南地区毒株进行全基因组重组分析。


经分析得出图株为高致病毒株与进行重组的重组毒株。


重组区域分别为段胶回收连接载体后测序,使用软件拼接序列,获得全基因序列全长为,命名为株。


图全基因扩增琼脂糖凝胶电泳扩增的个片段基因进化树构建与同源性分析应用软件对毒株与国内外代表性毒株进行全基因组进化树构建,结果如图所示。


遗传进化树分为欧洲型代表毒株和美洲型代表毒株两大分支,以为代表的美洲型又可进步分为以为代表的高致病毒株分支,以我国与为代表的低致病性毒株分支,以及美国为代表的分支和近年来出现的为代表的分支。


如图所示,株与华南地区近年新出现的重组毒同源性最高,结果显示,属于重组毒株,与的同源性为,与中国高致病性毒株同源性为,与美洲型经典毒株的同源性为,与同源性为,与欧洲型毒株同源性为。


序列比对和同源性分析结果显示,与高致病性毒株相似,在位存在氨基酸缺失。


序列比对以及同源性分析结果显示,毒株在抗原表位存在氨基酸突变。


经重组分析得出株为高致病性毒株与华南地区流行毒株的重组毒株,重组区域为。


关键词分离鉴定毒株猪繁殖与呼吸综合征病毒病毒学遗传进化重组猪繁殖与呼吸综合征可引起任何品种性别年龄的猪发病,其中易感性最高的是母猪和仔猪,且病毒分离采用细胞和细胞从样品中分离。


将处理好的临床样品感染和细胞,盲传代,并观察细胞病变效应,。


收毒后反复冻融次,每代取细胞培养液于无酶的离心管中,用于提取核酸和检测。


表扩增全基因序列引物间接免疫荧光试验将细胞和接至孔细胞培养板中,臵于细胞培养箱中培养后弃掉培养液,缓冲液洗涤次。


每孔接种上述滤过液,设立空白对照,放在于细胞培养箱中孵育后弃掉液体,轻轻冲洗次,各孔加入含有的细胞维持液,观察培养后弃掉培养液,洗涤次,各孔加进固定液于固定,弃掉液体收集上清后在超净工作台中用微孔过滤器过滤,取滤液用于病毒核酸提取,并通过进行猪繁殖与呼吸综合征病毒猪瘟病毒猪流行性腹泻病毒猪细小病毒检测,其余滤液臵于保存备用。


基因克隆测序扩增产物经过电泳鉴定后,使用公司提供的胶回收试剂盒进行胶回收。


取胶回收产物连接,转化后挑菌鉴定,将阳性菌液送往生物公司测序。


序列分析表所示代表毒株基因序列均来自。


运用与软件将测序毒株与国内外代表毒株进行序列比对和进化树构建,并将毒株与基因氨基酸序为高致病性毒株与华南地区流行毒株的重组毒株,重组区域为。


关键词分离鉴定毒株猪繁殖与呼吸综合征病毒病毒学遗传进化重组猪繁殖与呼吸综合征可引起任何品种性别年龄的猪发病,其中易感性最高的是母猪和仔猪,且感染后出现严重的临床症状。


是导致母猪发热厌食早产流产死胎弱仔等繁殖障碍和仔猪呼吸道症状为主要特征的传染病。


目前猪繁殖与呼吸综合征病毒分为个基因型基因型和基因型,代表性毒株分别为欧洲型和美洲型。


中国内陆于年首次发现,并在年成功分离出第株毒株年,中国南方地区出现由变异性毒株引起的高发病率和高死亡率的疫情,随后蔓延至全国大部参考文献张涵,解长占,张世亨,等株的全基因序列测定及遗传进化分析中国兽医学报,于林洋,董建国,张乐宜,等猪繁殖与呼吸系统综合征病毒华南株的分离鉴定及遗传进化分析广东农业科学,张驰,董建国,于林洋,王爽云,范兰兰,张乐宜,刘燕玲,王磊,宋长绪猪繁殖与呼吸综合征病毒华南株全基因组测序与遗传进化分析畜牧与兽医,基金国家重点研发计划十农村领域国家科技计划项目年乡村振兴战略专项构建现代农业体系重大动物疫病防控技术研究和推广项目广东省重点领域研发计划项目非洲猪瘟应急综合防控技术研究及应用广东省畜禽地方品种保护与研发利用提升工程。


摘要为监测猪繁殖与呼吸综合征病毒毒株同源性进行比较和构建进化树分析。


全基因组分析中与同源性最高,为。


是最大的非结构蛋白,容易发生缺失和突变,基因长度约为。


毒株氨基酸序列比对结果与高致病性毒株和高致病疫苗株相似,在位存在个不连续氨基酸的缺失,符合高致病性毒株特点。


美洲型毒株蛋白的表位有个,和为非中和表位,为中和表位。


与美洲型代表毒株相比,在非中和表位中有个的变异在位有突变,该突变与高致病性毒株及其疫苗株相同在位有突变,该突变与经典毒株和高致病性毒株及其疫苗株相同。


中和表位中,在位有个突变,该突变与高致病性探究猪繁殖与呼吸综合征病毒基因的变异情况病毒学论文列与国内外代表毒株进行比对分析。


通过软件对株进行全基因重组分析。


探究猪繁殖与呼吸综合征病毒基因的变异情况病毒学论文。


引物的设计与合成根据中发布的毒株全基因组序列进行生物信息学分析,选取保守区域设计对特异性引物表用于扩增序列,引物由生工生物工程上海股份有限公司合成。


病料处理取肺脏组织剪碎,加入在冰上充分研磨。


将研磨液倒入洁净的离心管中,离心,收集上清后在超净工作台中用微孔过滤器过滤,取滤液用于病毒核酸提取,并通过进行猪繁殖与呼吸综合征病毒猪瘟病毒猪流行性腹泻病毒猪细小病毒检测,其余滤液臵于保存备固定液于固定,弃掉液体,洗涤次然后各孔加入室温穿膜,弃掉液体后洗涤次加入的∶倍稀释的抗鼠源抗蛋白单抗,臵于孵育,期间每轻轻摇晃次,确保充分吸附,弃去液体后洗涤次避光加入稀释后的荧光抗标记的羊抗鼠,条件下避光作用,洗涤次,臵于荧光显微镜下进行观察。


引物的设计与合成根据中发布的毒株全基因组序列进行生物信息学分析,选取保守区域设计对特异性引物表用于扩增序列,引物由生工生物工程上海股份有限公司合成。


病料处理取肺脏组织剪碎,加入在冰上充分研磨。


将研磨液倒入洁净的离心管中,离心毒株在位存在个不连续氨基酸的缺失,此外在位存在突变。


运用软件对和国内外参考毒株进行氨基酸序列比对图。


在位有变异在位有突变在位有突变在位有个突变。


此外还存在多个突变位点,在位存在突变,位有突变,位有突变,位有突变。


图氨基酸序列比对结果方框中为核苷酸变异位点,下同图氨基酸序列比对结果全基因重组部位特征分析运用软件将株与高致病性毒株和近年来华南地区毒株进行全基因组重组分析。


经分析得出图株为高致病毒株与进行重组的重组毒株。


重分地区,给我国养猪业造成了严重的经济损失。


病毒分离采用细胞和细胞从样品中分离。


将处理好的临床样品感染和细胞,盲传代,并观察细胞病变效应,。


收毒后反复冻融次,每代取细胞培养液于无酶的离心管中,用于提取核酸和检测。


表扩增全基因序列引物间接免疫荧光试验将细胞和接至孔细胞培养板中,臵于细胞培养箱中培养后弃掉培养液,缓冲液洗涤次。


每孔接种上述滤过液,设立空白对照,放在于细胞培养箱中孵育后弃掉液体,轻轻冲洗次,各孔加入含有的细胞维持液,观察培养后弃掉培养液,洗涤次,各孔加进基因变异情况,对广东地区猪场患有猪繁殖与呼吸综合征仔猪的肺脏样品进行检测及病毒分离,在猪肺泡巨噬细胞上成功分离株病毒并命名为株,然而分离的毒株不能感染细胞。


全基因组进化分析同源性比对及重组分析结果显示,属于重组毒株,与的同源性为,与中国高致病性毒株同源性为,与美洲型经典毒株的同源性为,与同源性为,与欧洲型毒株同源性为。


序列比对和同源性分析结果显示,与高致病性毒株相似,在位存在氨基酸缺失。


序列比对以及同源性分析结果显示,毒株在抗原表位存在氨基酸突变。


经重组分析得出株及其疫苗株相同。


株是华南地区年出现的重组毒株,相关文章报道其能造成临床发病率为,死亡率为,现研究表明该毒株只能感染细胞,对不具有感染性。


毒株是高致病毒株,临床试验表明其能造成发病率和死亡率高达,均能使和感染。


全基因重组部位特征分析表明与重组,重组区域。


这个片段编码病毒复制酶聚合酶,它们的重组可能与毒株不能感染细胞相关。


综上所述,毒株为与的重组毒株,具有致病性增强的潜在风险,加大了广东地区防控的难度,因此有必要开发新型疫苗预防疾病的发生,并早日解决感染与流行的问题。


组区域分别为。


图毒株重组

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