冬科剪接基因的功能注释及富集分析对于雄花与两性花各发育时期中发生可变剪接的基因,本研究采用软件分析了各样本中共有及特有的可变剪接基因数量。
应用软件,获得包括生物学过程分子功能和细胞构成等类别的注释编号。
利用在线工具进行功能富集分析,统计每个类别中基因与背景基因间的差异,并对值进行校正。
定义校无柱头,有的既无花柱也无柱头。
两性花含有完整的雄蕊,雌蕊发育完全,含有子房花柱和柱头,并能正常结实,。
因此,两性花是研究植物花器官发育性别决定与分化的特殊遗传材料。
此外,由于两性花自花或异花授粉,产生超雄株。
以它作为父本产生的后代全部为雄株。
已有研究表明,芦笋雄株产量较同期雌株高,因此培育全雄品种是芦笋育种的重要方向,而两性株是培育芦笋全雄品种的重要资源材料。
但自然界中存在的两性株极少,探析芦笋两性花与雄花的碳氮比及氮化合物相关基因可变剪接的不同农业化学论文中含碳量与雄花蕾相当,但含氮量仍然显著高于雄花蕾。
可见,较低的碳氮比有利于两性花蕾中雌蕊的发育。
测序及富集分析表明,有个氮化合物相关基因只在两性花蕾中发生可变剪接,这些基因主要编码核糖体蛋白转录因子和些酶类物质等,并且在性别分化的前期中期,分别有,个基因表达量高于雄花蕾。
这与两性花蕾中氮化合物含量高于雄花蕾的差异致。
综上所述,氮化合物代谢相关基因的可变剪接及较高的表达量和较低的碳氮比有利于两性花雌机理。
材料和方法试验材料以芦笋品种冠军为试验材料,并将其种植于川省农业科学院经济作物育种栽培研究所试验基地。
在年春季芦笋现蕾期开花期进行形态学观察。
在芦笋盛花期分别挑取株正常生长且生长较致的两性株和雄株,按照花蕾从小到大分为共个级别,在体式显微镜下对其形态特征进行观察比较,每级观察个花蕾。
花蕾从植株上摘下后,立即观察,将花蕾半的花瓣剥离,臵化的中期和后期分别有,个。
这些剪接事件在雄花中并未检测到,说明氮化合物代谢相关基因可能与两性花的形成相关。
基因发生可变剪接以后可能引起其编码蛋白的含量及功能改变,这结论正好与前面试验中检测到芦笋两性花与雄花蕾中氮化合物含量存在差异相吻合。
探析芦笋两性花与雄花的碳氮比及氮化合物相关基因可变剪接的不同农业化学论文。
已有研究表明,碳氮比与植物花芽性别分化相关,。
碳氮化合物是植物花芽分化过程中重要的营养物质。
世纪初提出的碳氮比学说表芦笋两性花特有可变剪接基因中氮化合物代谢相关基因的分类信息找到芦笋两性花特有的可变剪接基因中个氮化合物代谢相关基因在芦笋参考基因组上的注释信息表,发现它们主要为编码核糖体蛋白基因转录因子和些酶类物质等,其中以编码核糖体蛋白基因数量最多。
表明,芦笋两性花的形成与核糖体蛋白基因转录因子和些酶类物质等氮化合物代谢相关。
表芦笋两性花特有可变剪接基因中氮化合物代谢相关基因的注释信息芦笋两性花特有可变剪接,碳氮比理论认为碳氮比对植物花性别的分化有较大的影响,。
肖华山等发现荔枝花中较小的比值和较高的氨基酸含量有利于雌蕊分化。
表芦笋两性花与雄花不同发育时期碳氮化合物含量的变化注时期为花蕾发育至时期为花蕾发育至时期为花蕾发育至。
。
表中数据为平均值标准差,采用检验法检验了数据显著性,同发育时期相同指标不同小写字母表示两性花与雄花差异显著。
芦笋两性花雄花氮化合物相关基因可变剪接事件的差异分析为了解芦笋两性花雄花变,这结论正好与前面试验中检测到芦笋两性花与雄花蕾中氮化合物含量存在差异相吻合。
探析芦笋两性花与雄花的碳氮比及氮化合物相关基因可变剪接的不同农业化学论文。
表芦笋两性花与雄花不同发育时期碳氮化合物含量的变化注时期为花蕾发育至时期为花蕾发育至时期为花蕾发育至。
。
表中数据为平均值标准差,采用检验法检验了数据显著性,同发育时期相同指标不同小写字母表示两性花与雄花差异显著。
芦笋两性花雄花氮化合物相关基因可变剪接它们主要为编码核糖体蛋白基因转录因子和些酶类物质等,其中以编码核糖体蛋白基因数量最多。
表明,芦笋两性花的形成与核糖体蛋白基因转录因子和些酶类物质等氮化合物代谢相关。
表芦笋两性花特有可变剪接基因中氮化合物代谢相关基因的注释信息芦笋两性花特有可变剪接基因中个氮化合物代谢相关基因在个发育时期均发生了可变剪接事件,并且个发育时期内共发生了个可变剪接事件表。
进步反映了可变剪接与氮化合物合成相关基因表达的关系非两性花雄花发育与碳氮化合物的关系,本研究比较分析了芦笋两性花与雄花不同发育阶段碳氮化合物含量及相关基因表达水平的动态变化,将有助于揭示芦笋两性花与雄花发育的调控机理。
材料和方法试验材料以芦笋品种冠军为试验材料,并将其种植于川省农业科学院经济作物育种栽培研究所试验基地。
在年春季芦笋现蕾期开花期进行形态学观察。
在芦笋盛花期分别挑取株正常生长且生长较致的两性株和雄株,按照花蕾从小到大分为,探析芦笋两性花与雄花的碳氮比及氮化合物相关基因可变剪接的不同农业化学论文中发生可变剪接基因的功能,对所有发生可变剪接的基因进行了分析。
结果表明,芦笋两性花与雄花相比,其特有可变剪接基因显著富集到细胞氮化合物代谢过程有机氮化合物代谢过程和细胞氮化合物生物合成过程等条氮化合物代谢相关的条目中,共包含相关基因个表,而雄花特有可变剪接基因在此条目中没有富集,反映了氮化合物代谢相关的条目与芦笋两性花发育的关系十分紧密。
探析芦笋两性花与雄花的碳氮比及氮化合物相关基因可变剪接的不同农业化学论文相关基因的可变剪接类型此外,在芦笋两性花发育进程中,个氮化合物代谢相关基因中有个基因表达量在性别分化中期低于性别分化前期,有个基因表达量在性别分化后期低于性别分化中期,这与两性花中氮化合物含量逐渐降低的变化趋势致。
在芦笋雄花由性别分化前期到中期的过程中,有个基因表达量降低在性别分化中期到后期的过程中,有个基因表达量降低,个基因表达量略有升高,这与雄花中氮化合物含量先降低后略升高的变化趋势致。
讨论在众多的植物花芽分化研究理论中花柱和柱头,并能正常结实,。
因此,两性花是研究植物花器官发育性别决定与分化的特殊遗传材料。
此外,由于两性花自花或异花授粉,产生超雄株。
以它作为父本产生的后代全部为雄株。
已有研究表明,芦笋雄株产量较同期雌株高,因此培育全雄品种是芦笋育种的重要方向,而两性株是培育芦笋全雄品种的重要资源材料。
但自然界中存在的两性株极少,这极大地限制了芦笋种质资源创新和全雄品种选育。
因此,研究芦笋性别调控机理,事件的差异分析为了解芦笋两性花雄花中发生可变剪接基因的功能,对所有发生可变剪接的基因进行了分析。
结果表明,芦笋两性花与雄花相比,其特有可变剪接基因显著富集到细胞氮化合物代谢过程有机氮化合物代谢过程和细胞氮化合物生物合成过程等条氮化合物代谢相关的条目中,共包含相关基因个表,而雄花特有可变剪接基因在此条目中没有富集,反映了氮化合物代谢相关的条目与芦笋两性花发育的关系十分紧密。
表芦笋两性花特有可变剪接基因中氮化合物代常密切。
这些基因发生可变剪接的类型主要有种,其中以类型最多,次之,最少。
并且在不同的发育时期,大多数基因发生可变剪接事件的类型和次数存在差异。
个基因发生可变剪接事件的时间主要在两性花性别分化前期,该时期中发生了次及以上可变剪接的基因有个,而在两性花性别分化的中期和后期分别有,个。
这些剪接事件在雄花中并未检测到,说明氮化合物代谢相关基因可能与两性花的形成相关。
基因发生可变剪接以后可能引起其编码蛋白的含量及功能改共个级别,在体式显微镜下对其形态特征进行观察比较,每级观察个花蕾。
花蕾从植株上摘下后,立即观察,将花蕾半的花瓣剥离,臵于体式显微镜下观察拍照,对比同时期的两性花雄花花蕾的形态差异,具两性花特点并且后期结出果实的雄性雌型株标记为两性株。
表芦笋两性花特有可变剪接基因中氮化合物代谢相关基因的分类信息找到芦笋两性花特有的可变剪接基因中个氮化合物代谢相关基因在芦笋参考基因组上的注释信息表,发为促进两性花形成和丰富芦笋资源材料奠定基础。
已有研究表明,碳氮比与植物花芽性别分化相关,。
碳氮化合物是植物花芽分化过程中重要的营养物质。
世纪初提出的碳氮比学说认为碳氮比对控制花芽分化起着重要作用。
在希尔核桃中,发现的缺乏会加剧雌花败育,并且雌花败育时,年生核桃枝条木质部中的氮和淀粉含量降低到最低点。
张建铭等研究大花栀子花芽分化过程中碳氮比的变化,发现在花芽孕育期碳氮比急剧升高,推测碳氮比对于花芽孕育起着主要的作用。
为探明芦笋探析芦笋两性花与雄花的碳氮比及氮化合物相关基因可变剪接的不同农业化学论文天门冬属多年生植物,由于其具有较高的营养价值和较好的药用保健功能而深受人们喜爱。
芦笋雌雄异株,其性染色体处于植物性染色体进化途径的中间位臵,性别表现出多种类型,包括雌株雄株超雄株和雄性雌型株简称两性株,基因型为。
它们之间主要的差异表现在花器官上。
雌花具有健全的雌蕊,但雄蕊高度退化而雄花具有发育良好的雄蕊,但雌蕊发育不完全,有的形成花柱,无柱头,有的既无花柱也无柱头。
两性花含有完整的雄蕊,雌蕊发育完全,含有子房后的为该基因集在此项中显著富集。
摘要为探明芦笋两性花雄花发育与碳氮比及氮化合物的关系,测定了芦笋两性花与雄花性别分化的前期中期后期个时期花蕾的碳氮化合物含量,并采用技术分析了个样品中相关氮化合物基因的可变剪接及表达量的差异。
结果发现,在性别分化的前期中期,两性花蕾中含碳量低于雄花蕾,但含氮量却显著高于雄花蕾在性别分化后期,两性花蕾中含碳量与雄花蕾相当,但含氮量仍然显著高于雄花蕾。
可见,较低的碳氮比有利于两这极大地限制了芦笋种
















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