表达,另个靶基因家族成员及其靶基因对的应答模式,为西瓜抗性基因因子获得及分子机理研究奠定了基础。
参考文献孙玉燕,何艳军,牛晓伟,崔狄,范敏西瓜靶基因鉴定及其对黄瓜绿斑驳花叶病毒侵染应答的分析园艺学报,孙玉燕,张慧青,范敏,何艳军,郭平安西瓜胁迫下家族成员及靶基因的鉴定分析核农学报,。
本研究前期通过对侵染前后的西瓜材料进行高通量测序,鉴定获得了家族的个成员,及其中在侵染后呈现抑制表达,而在侵染后呈现诱导表达。
为进步明确在胁迫应答中的作用,本研究从西瓜材料中分离并克隆家族成员的前体基因并对其进行系统进化分析,分析其启动子区的顺式作用元件对的靶基因及剪切位点进行鉴定,对靶基因的功能特化是通过表达差异和序列差异实现的。
本研究中西瓜的个靶基因和,同时也作为的靶基因,受到和的共同调控。
除此之外,与也存在相互作用,前体异常的长折叠结构与的加工有关。
和的几乎互补的核苷酸序列构成了基因调控的分子机制。
单核苷酸突变可降低其靶向个基因的能力。
本研究中,西瓜家族的个成员靶向个转录因子基因,个转录因子基因,剪切位点在家族成员成熟序列端第位碱基。
根据转录组测序的结果,仅与靶基因的表达表现为负相关。
分析其原因主要是同个靶基因受不同的调控,如除受和的调控,还受的调控,调控机制较杂,需进步研究。
研究发现的靶基因调控的生物合成及信号转导过程。
西瓜胁迫下家族成员及靶基因的鉴定分析瓜果园艺论文和侵染后呈现上调表达,在侵染后呈现下调表达与相比,在侵染和后呈现上调表达图。
结果表明,绝大部分靶基因在不同侵染阶段的表达与转录组测序致。
上述转录组测序结果及结果均表明,对靶基因的表达表现为负调控。
讨论目前,参与植物对胁迫应答的越来越多地被挖掘出来。
对接种前后的黄瓜进行高通量测序,获得多个参与胁迫应答的新的保守的成员。
本研究前期通过对侵染前后的西瓜叶片进行高通量测序,获得些参与胁迫应答的,如及。
通过靶向转录因子参与西瓜对的胁迫应答。
研究表明,在植物对生物胁迫应答中行业带来全球性危害。
因此,加强的防治,提高西瓜对的抗性是我国乃至全球西瓜生产亟需解决的重要问题。
表降解组测序获得家族成员靶基因图启动子区顺式作用元件分析表靶基因生物信息学分析靶基因的表达分析根据侵染前后西瓜叶片的转录组测序结果,对靶基因的表达进行分析。
在侵染后及呈现上调表达及呈现下调表达。
此外,所有靶基因在侵染后均呈现下调表达,其中及呈现显著下调表。
根据前期高通量测序,家族成员及在侵染前后的表达结果表,即及在侵染后分别呈现显著下调及下调表达,而及的靶基因析,转录组测序及分析靶基因的表达模式。
研究结果获得家族成员共同前体基因,其长度为,含有完整的茎环结构序列比对显示,家族成熟序列在端第第位碱基高度保守西瓜与个物种的条前体序列经系统进化分析后分为个分支,其中西瓜与马铃薯前体基因距离最近启动子区含有光响应元件赤霉素响应元件乙烯响应元件茉莉酸甲酯响应元件和等多个顺式作用元件降解组测序获得家族成员的个靶基因,其中和注释为转录因子,注释为转录因子,剪切位点位于家族成员成熟序列端的第位碱基靶基因编码氨基酸数目为分子量为理论等电点为,定位于细胞核细胞质中,均不含跨膜结构域转录组测序及靶基因预测及相关生物学分析根据前期降解组测序的结果处理前后的叶片混样,个生物学重复,对的靶基因及其靶切割位点进行分析。
利用对靶基因编码蛋白质的结构域进行分析对靶基因编码蛋白的氨基酸数目相对分子量理论等电点进行分析预测靶基因编码的蛋白质是否含有跨膜结构域在线软件对靶基因的亚细胞定位进行预测。
转录组测序及分析靶基因在不同侵染阶段的表达根据本研究前期的结果,获得的靶基因在不同侵染阶段和的表达,明确与靶基因的靶调控关系。
此外,进步利用分析靶基因在不同侵染阶段和的表达。
利用天根生化科技北京有限公司将约总反转录成熟体序列在端第第位以及位碱基具有较高的保守性,而在端第第第第位碱基存在差异图。
这些碱基差异可能使不同物种的成员作用于不同的靶基因,进而产生不同的功能。
选取数据库中个物种的条前体序列,与西瓜起通过进行系统进化分析,可将这些前体序列分为大分支。
第分支含有个成员,第分支含有个成员,第分支含有个成员,第分支含有个成员,表明在不同物种间的进化关系上存在差异性。
其中西瓜位于第分支,亲缘关系与马铃薯的前体基因最近图。
图形成的茎环结构及家族成员的成熟序列启动子区顺式作用元件分析对上游启动子区所含的顺式作用元件进行分析,发现其含有多个顺式作用元件图。
包括基因启动子和增强子区的顺式作用元件和光响应元件,的严重威胁。
属于芜菁花叶病毒科烟草花叶病毒属,为正单链线状病毒,病毒粒体为杆状,大小为。
主要侵染西瓜甜瓜黄瓜等葫芦科作物,可通过种子花粉土壤介体机械接触和水源等多种途径进行传播,。
自年至今,已报道在全世界多个国家和地区均有分布,。
近年,传播速度迅速加快,影响了葫芦科作物尤其是西瓜产业的发展,给商业育种育苗培育种子贸易产品生产和零售等行业带来全球性危害。
因此,加强的防治,提高西瓜对的抗性是我国乃至全球西瓜生产亟需解决的重要问题。
靶基因预测及相关生物学分析根据前期降解组测序的结果处理前后的叶片混样,个生物学重复,对的靶基因及其靶切割位点进行分析。
利用对靶基因编码蛋白质的结构域进行绿斑驳花叶病毒侵染应答的分析园艺学报,孙玉燕,张慧青,范敏,何艳军,郭平安西瓜胁迫下家族成员及靶基因的鉴定分析核农学报,。
摘要为明确家族成员及在黄瓜绿斑驳花叶病毒胁迫应答中的作用,本研究将的成熟序列与西瓜基因组进行比对获得其前体基因,利用对前体基因进行系统进化分析,对前体基因启动子区的顺式作用元件进行分析,降解组测序对的靶基因进行分析,转录组测序及分析靶基因的表达模式。
研究结果获得家族成员共同前体基因,其长度为,含有完整的茎环结构序列比对显示,家族成熟序列在端第第位碱基高度保守西瓜与个物种的条前体序列经系统进化分析后分为个分支,其中西瓜与马,前体异常的长折叠结构与的加工有关。
和的几乎互补的核苷酸序列构成了基因调控的分子机制。
单核苷酸突变可降低其靶向个基因的能力。
本研究中,西瓜家族的个成员靶向个转录因子基因,个转录因子基因,剪切位点在家族成员成熟序列端第位碱基。
根据转录组测序的结果,仅与靶基因的表达表现为负相关。
分析其原因主要是同个靶基因受不同的调控,如除受和的调控,还受的调控,调控机制较杂,需进步研究。
研究发现的靶基因调控的生物合成及信号转导过程。
侵染方面诱导的表达,抑制的表达,另方面水稻内源水平降低,表明可诱导介导的防御机制,调控水稻对的抗性。
本研究通过对启动子区的顺西瓜胁迫下家族成员及靶基因的鉴定分析瓜果园艺论文和赤霉素响应元件和乙烯响应元件茉莉酸甲酯响应元件和类黄酮生物合成基因调控元件分生组织表达响应元件以及和等顺式作用元件。
西瓜胁迫下家族成员及靶基因的鉴定分析瓜果园艺论文。
前体基因序列及成熟序列比对及系统进化分析提取数据库中个物种的条的前体序列,利用法构建西瓜与其他物种前体基因的系统进化树。
此外,选取来自不同物种的成熟序列,与西瓜成熟序列进行序列比对和系统进化分析。
前体基因启动子区顺式作用元件分析提取西瓜上游的序列,利用软件对其所包含的顺式作用元件进行预测和分析,美国中完成。
反应程序预变性,变性,退火,延伸,次循环,次生物学重复。
采用法计算基因相对表达量。
所用引物及序列见表。
前体基因序列及成熟序列比对及系统进化分析提取数据库中个物种的条的前体序列,利用法构建西瓜与其他物种前体基因的系统进化树。
此外,选取来自不同物种的成熟序列,与西瓜成熟序列进行序列比对和系统进化分析。
前体基因启动子区顺式作用元件分析提取西瓜上游的序列,利用软件对其所包含的顺式作用元件进行预测和分析。
图扩增家族成熟序列的比对及前体基因系统进化分析选取数据库中个物种的条成熟序列,与西瓜成熟序列进行序列比对和系统进化分析。
序列比对显示,成靶基因在不同侵染阶段的表达与转录组测序致。
上述转录组测序结果及结果均表明,对靶基因的表达表现为负调控。
讨论目前,参与植物对胁迫应答的越来越多地被挖掘出来。
对接种前后的黄瓜进行高通量测序,获得多个参与胁迫应答的新的保守的成员。
本研究前期通过对侵染前后的西瓜叶片进行高通量测序,获得些参与胁迫应答的,如及。
通过靶向转录因子参与西瓜对的胁迫应答。
研究表明,在植物对生物胁迫应答中发挥重要的作用。
水稻齿叶矮缩病毒侵染可诱导的表达,抑制靶基因的表达,水平降低,表明侵染可诱导介导的防御机制。
因此,进步对及靶基因进行分析对靶基因编码蛋白的氨基酸数目相对分子量理论等电点进行分析预测靶基因编码的蛋白质是否含有跨膜结构域在线软件对靶基因的亚细胞定位进行预测。
转录组测序及分析靶基因在不同侵染阶段的表达根据本研究前期的结果,获得的靶基因在不同侵染阶段和的表达,明确与靶基因的靶调控关系。
此外,进步利用分析靶基因在不同侵染阶段和的表达。
利用天根生化科技北京有限公司将约总反转录成,以作为内参基因。
使用试剂盒北京全式金生物技术有限公司,在铃薯前体基因距离最近启动子区含有光响应元件赤霉素响应元件乙烯响应元件茉莉酸甲酯响应元件和等多个顺式作用元件降解组测序获得家族成员的个靶基因,其中和注释为转录因子,注释为转录因子,剪切位点位于家族成员成熟序列端的第位碱基靶基因编码氨基酸数目为分子量为理论等电点为,定位于细胞核细胞质中,均不含跨膜结构域转录组测序及分析表明负调控靶基因的表达。
本研究结果进步明确了家族成员在胁迫应答中的作用及
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