非进展性病变的微生物群落组成存在相当多的重叠，表明不能仅通过研究龈的研究进展口腔医学研究，基金国家自然科学基金编号。

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以上提示我们在研究微生物群落与疾病关系时应该考虑整个群落的行为变化，而不是仅着眼于种或多种特定病原体的活动。

关键词口腔微生物口腔疾病口腔颌面测序技术转录组微生物组词最早由提出，是存在于人体体内或表面的共生共栖和致病的微生物群落的总称。

最近，美国独立卫生研究院建立人体微生物组综合项目，旨在通过不口腔疾病中口腔微生物宏转录组的研究进展口腔临床医学毕业系的重要手段之。

转录组是识别关键环境信号的起点，这些信号转变会改变群落的行为，可能导致正常微生物群落失调。

宏转录组分析不仅可以让学者更直观地了解疾病相关活跃微生物，也能够帮助学者更深入地探究微生物组功能行为的变化。

但是，迄今为止，口腔微生物组转录组学研究仅针对龋病牙周炎口腔癌等少数几类疾病，其他口腔疾病也需要此类研究。

口腔微生物组真菌级别的宏转录组也鲜见报道，这也可能是影响整个微生物组动态的重要因素之。

此外，宏转录组不定代表微生物群卟啉单胞菌链球菌和普雷沃特氏菌等。

但尚未发现微生物群落组成与口腔癌之间有明确的联系。

等通过个样本的微生物宏转录组学研究发现，相较于健康受试者匹配部位，口腔鳞状细胞癌患者肿瘤部位的活性微生物群落发生了显著改变。

梭杆菌属硒单胞菌属氧化碳噬纤维菌属小杆菌属和约翰森氏菌属在肿瘤部位丰度明显上调。

此外，在功能方面，铁离子结合色氨酸酶活性谷氨酸脱氢酶活性淀粉合成酶活性和超氧化物歧化酶的活性在肿瘤部位明显高表达。

与上述研究活动提供新的依据。

牙周炎的另个研究热点在于疾病不同阶段的微生物组研究。

研究表明，进展性病变和非进展性病变的微生物群落组成存在相当多的重叠，表明不能仅通过研究龈下微生物组成差异来解释病损部位的牙周状态差异，。

等通过对牙周炎不同阶段的宏转录组分析发现，相较于基线，进展期的钾和氨基酸运输肽聚糖分解代谢类异戊烯生物合成多糖生物合成和蛋白激酶活化相关蛋白耦联受体信号转导途径表达降低。

而非进展期微生物群落功能相较于其基线并未发生显著除明确疾病状态下的活跃微生物群落外，宏转录组分析还可以给出整体微生物群落功能特征与疾病的相互作用信息。

等对儿童龋病进行微生物宏转录组分析发现，牙本质龋微生物组相较于冠部龋和无龋对照组拥有更加复杂的基因多样性。

其中又以甘油激酶尿嘧啶糖苷酶和尿素酶基因表达最高。

甘油激酶则作为糖酵解途径的部分参与到了龋病微生物的代谢中。

而尿素酶被证实可以通过氨的产生来提升，降低龋活跃性。

等通过对已存在的宏转录组库分析发现属也可能与龋病相关。

这表明龋病是由多种微生物组成的复杂群体共同作用的结果，这些发现使得龋病病因学研究由特定致病菌致病转向群落致病。

等通过对龋损部位微生物的宏转录组分析发现，在龋损部位存在着高转录活性的微生物群落活性微生物群落，且具有高度多样性。

此外，该研究还发现牙釉质龋和牙本质龋中存在不同的微生物活跃群体，结果显示链球菌罗氏菌韦荣菌等在牙釉质龋活性微生物群落中丰度较高，而乳酸杆菌假分歧杆菌环孢素菌则在牙本质龋和牙本质龋中存在不同的微生物活跃群体，结果显示链球菌罗氏菌韦荣菌等在牙釉质龋活性微生物群落中丰度较高，而乳酸杆菌假分歧杆菌环孢素菌则在牙本质龋中高检出。

作为传统致龋菌的变异链球菌虽然存在于龋活跃微生物组中，但在所有样本中的检出率均极低牙釉质龋为，开放性牙本质龋为，隐匿性牙本质龋为。

等发现在龋病病损的龈上菌斑中链球菌属的活性转录表达最为丰富，其次为韦荣菌属和放线菌属均为。

进步的种水平宏转录组分析发现活性转录表达较高糖代谢途径个组组与龋病的发生发展密切相关。

其中糖磷酸转移酶参与的葡萄糖苷代谢，是细菌生物膜形成的关键，在细菌定植中起着重要作用。

而来自果糖和甘露糖代谢途径的组能将山梨醇转化为磷酸果糖，这表明在龋病中，山梨醇可能被用作额外的碳源参与细菌代谢。

以上结果提示基于群落功能的宏转录组研究方法可以识别潜在的活性表达基因和相关物种，为探究健康或疾病状态下可能的群落活动提供新的依据。

长期以来，以变异链球菌为代表的值得未来研究采取的方法。

参考文献李燕，何金枝，肖丽英，等口腔微生物组与疾病国际口腔医学杂志，陈婧，程磊，周学东，等龋病微生物因素研究进展华西口腔医学杂志，肖炜卓，张龙，王晓冬，等慢性牙周炎患者龈下菌斑宏转录组学分析中国医药导报，苏志飞，李继遥口腔微生物宏转录组在口腔疾病中的研究进展口腔医学研究，基金国家自然科学基金编号。

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除明确疾病状态下的活跃微生物群落外，宏转录组分口腔疾病中口腔微生物宏转录组的研究进展口腔临床医学毕业质龋中高检出。

作为传统致龋菌的变异链球菌虽然存在于龋活跃微生物组中，但在所有样本中的检出率均极低牙釉质龋为，开放性牙本质龋为，隐匿性牙本质龋为。

等发现在龋病病损的龈上菌斑中链球菌属的活性转录表达最为丰富，其次为韦荣菌属和放线菌属均为。

进步的种水平宏转录组分析发现活性转录表达较高的微生物依次为血球链球菌微小链球菌细小韦荣菌氧化碳噬纤维菌。

这些发现提示微生物组，尤其是具有高转录活性的微生物组，在龋病致病中具有不可忽视的作以前的非牙周致病菌也表达着大量的毒力因子，如马曲克氏锥虫齿状腺葡萄球菌细小细脉杆菌和干燥奈瑟菌等。

这与提出的群落致病的观点致，认为疾病是由微生物群落各部分的综合作用而并非单或少数细菌所导致的。

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长期以来，以变异链球菌为代表的产酸菌被认为是龋病的主要致病菌。

事实上，众多产酸菌属与耐酸菌属如乳酸杆菌属双歧杆菌属等被证明与龋活跃程度显著相关。

而放线菌属梭杆菌属卟啉单胞菌氨基酸和脂质的生物合成等基因表达上调。

值得注意的是，等也指出微生物组在肿瘤部位的代谢特征是保守的，这与等在牙周炎中观察到的现象致，进步验证了整体群落的功能变化与疾病发生发展密切相关。

总结与展望综上所述，微生物组的宏转录组学分析已成为探究微生物与疾病状态间相互关系的重要手段之。

转录组是识别关键环境信号的起点，这些信号转变会改变群落的行为，可能导致正常微生物群落失调。

宏转录组分析不仅可以让学者更直观地了解疾病相关活跃微的微生物依次为血球链球菌微小链球菌细小韦荣菌氧化碳噬纤维菌。

这些发现提示微生物组，尤其是具有高转录活性的微生物组，在龋病致病中具有不可忽视的作用。

等通过对牙周炎患者与正常人群的龈下菌斑微生物宏转录组分析发现牙周炎患者龈下菌斑的红色复合体高表达金属蛋白酶和铁代谢相关蛋白。

而无论是具有溶解作用的金属蛋白酶或是与毒力因子表达密切相关的铁代谢相关蛋白的上调均证实红色复合体在牙周炎破坏中不可或缺的作用。

此外，该研究还发现产酸菌被认为是龋病的主要致病菌。

事实上，众多产酸菌属与耐酸菌属如乳酸杆菌属双歧杆菌属等被证明与龋活跃程度显著相关。

而放线菌属梭杆菌属卟啉单胞菌属也可能与龋病相关。

这表明龋病是由多种微生物组成的复杂群体共同作用的结果，这些发现使得龋病病因学研究由特定致病菌致病转向群落致病。

等通过对龋损部位微生物的宏转录组分析发现，在龋损部位存在着高转录活性的微生物群落活性微生物群落，且具有高度多样性。

此外，该研究还发现牙釉析还可以给出整体微生物群落功能特征与疾病的相互作用信息。

等对儿童龋病进行微生物宏转录组分析发现，牙本质龋微生物组相较于冠部龋和无龋对照组拥有更加复杂的基因多样性。

其中又以甘油激酶尿嘧啶糖苷酶和尿素酶基因表达最高。

甘油激酶则作为糖酵解途径的部分参与到了龋病微生物的代谢中。

而尿素酶被证实可以通过氨的产生来提升，降低龋活跃性。

等通过对已存在的宏转录组库分析发现细菌代谢子网络包括来自磷酸转移酶系统和果糖甘露生物，也能够帮助学者更深入地探究微生物组功能行为的变化。

但是，迄今为止，口腔微生物组转录组学研究仅针对龋病牙周炎口腔癌等少数几类疾病，其他口腔疾病也需要此类研究。

口腔微生物组真菌级别的宏转录组也鲜见报道，这也可能是影响整个微生物组动态的重要因素之。

此外，宏转录组不定代表微生物群落的最终代谢产物。

蛋白质组学和代谢组学分析可以更明确地反映微生物组在不同条件下产生的功能蛋白和代谢产物情况。

因此，将宏转录组学蛋白质组学与代谢组学分析整合，是口腔疾病中口腔微生物宏转录组的研究进展口腔临床医学毕业位，口腔鳞状细胞癌患者肿瘤部位的活性微生物群落发生了显著改变。

梭杆菌属硒单胞菌属氧化碳噬纤维菌属小杆菌属和约翰森氏菌属在肿瘤部位丰度明显上调。

此外，在功能方面，铁离子结合色氨酸酶活性谷氨酸脱氢酶活性淀粉合成酶活性和超氧化物歧化酶的活性在肿瘤部位明显高表达。

与上述研究类似，等通过小鼠体内实验证明无论个体间群落组成如何改变，与口腔鳞状细胞癌相关的微生物组代谢特征均呈现出相似的表达变化，包括氮运输应激反应以及下微生物组成差异来解释病损部位的牙周状态差异，。

等通过对牙周炎不同阶段的宏转录组分析发现，相较于基线，进展期的钾和氨