当中又有约表达基因编码免疫相关蛋白。至今，关于数据依然在不断在扩充发展。截至年止，现已发现区域有个基因位点存在，该区域平均即有个基因。是迄今已知人类最复杂基因密度最高区域口中山大学硬士学位论文基因多态性及分子进化研究图展示了人类号染色体区域基因分布图。从染色体端粒至着丝点方向，依次排列着类类和类区域图。类区域包含个经典基因，个非经典基因，以及其它众多非编码蛋白基因或假基因。这些非经典分子多态性不如经典分子那么高，其生物学功能目前还不甚清楚。类区域介于类和类区域之间中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究，Ⅳ中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究引言二十世纪四十年代已经发现，鼠近交系之问进行正常组织移植排斥由分布在不同染色体上多个基因所决定。并证实这种捧斥实际上是种免疫反应，其中将诱导强烈而迅速排斥反应抗原称为主要组织相容性抗原，编码这种抗原基因群称为主要组织相容性复合体，张卓然，。目前已知脊椎动物包括鸟类鱼哺乳动物等都有系统，但尚未在比软骨鱼更古老脊椎动物中克隆到基因。不同动物在组成结构和功能及分布上彼此相似，但命名各不相同。其中，人类又称为人类白细胞抗原系统分为经典类二类和非经典三类区域。其中经典类区域有包含了三个经典基因和些非经典基因与假基因。和都具有重要免疫功能，其中更是全基因组中多态性最高位点之。这些特点使其自从被发现以来直是区域研究热点。广泛应用于基因功能与进化，器官移植研究法医鉴定个体识别，疾病相关性研究以及用于民族起源进化迁移融合等人类遗传学研究。长期以来人们根据低水平多态性和细胞膜表达量推测免疫功能有限。，对研究直滞后于其余两个经典类基因研究。但最近不同研究都表明情况并非完全如此,。而对研究大多局限在编码抗原结合槽外显子，更是缺乏完整中国人群数据。因此，本文对全长基因进行克隆分析，建立汉族个体图谱。对两个基因自身特点进行分析。另方面，结合本实验室过去对研究所做数据分析，探讨了最近对类基因研究些新观点。中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究第章研究进展基因分子结构和系统命名规则基因组图谱年，在分析小鼠血型抗原与肿瘤移植排斥关系时发现了小鼠组织相容性抗原，证实了机体对自身与非自身识别是有遗传基础。随后十余年研究里，研究人员通过不断杂交近交与回交先后获得了纯系小鼠与同类系小鼠，并将小鼠组织相容性基因定位于第号染色体上，称其为基因复合体。年，通过同种异体白细胞凝集实验和家系调查，第个发现了人类白细胞抗原抗原，首次证实了人类白细胞膜上抗原具有型特异性，并预言白细胞抗原系统匹对肾移植成功非常重要。其预言不仅被之后实践所证实，而且成为组织配型基本思想。抗原发现奠定了移植免疫学理论基础，开仓了人类免疫遗传学研究新纪元。覆盖号染色体短臂全长约区域，占人体整个基因组，从中心粒端至端粒端依次为经典类非经典类和经典类。其问包含了众多在免疫系统中发挥重要功能基因，也是基因组中基因密度最高区域。由于其在免疫学等多方面重要研究价值，早在年等人就发表了第张人类基因图谱。国际单倍型计划和实验中心各自计划开展，以及实验技术在近几年长足进步，首张基于精确测序全长图谱在年完成绘制。共发现了个基因位点，其中有个是可表达，而这当中又有约表达基因编码免疫相关蛋白。至今，关于数据依然在不断在扩充发展。截至年止，现已发现区域有个基因位点存在，该区域平均即有个基因。是迄今已知人类最复杂基因密度最高区域口中山大学硬士学位论文基因多态性及分子进化研究图展示了人类号染色体区域基因分布图。从染色体端粒至着丝点方向，依次排列着类类和类区域图。类区域包含个经典基因，个非经典基因，以及其它众多非编码蛋白基因或假基因。这些非经典分子多态性不如经典分子那么高，其生物学功能目前还不甚清楚。类区域介于类和类区域之间,以中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化嗍究。,蚵,口中山大学硕上学位论文，基因多态性及分子进化研究附录引用数据附表基因各区域核苷酸多态性水平及中性检验胡青松，由于相对较短，且都是编码蛋白质胞内部分，所以合并到起计算即表示所标，类似也合并计算，标为附表含有潜在结构。中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究附图基因重组模型也壁￡筮!戤望血翊也幽逝卿竖垦区￡墅鉴堡。口条双男中攀链彳霹二二了口亏芦三号乒。鼻些牌亡，二二口，口中山大学硕上学位论文摹因多态性及分子进化研究附图类和二类基因启动子对比。和顺次标注。,中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究，中山大学硕士学位论文基田多卷性及分子进化研究，基因多态性及分子进化研究专业生物化学与分子生物学硕士研究生林文治导师徐安龙教授吴玉萍教授摘要人类主要组织相容性抗原系统，即白细胞抗原系统，是人类基因组中多态性最高区域，其编码糖蛋白分子在人类免疫反应中起着至关重要作用。通过对基因分子结构以及分子进化研究可以获得许多该基因功能上信息，对进步了解其生物学功能有主要指导作用。首先，本文采用“长片段扩增克隆测序后拼接”策略，获得了条中国汉族个体全长和条全长单倍型序列，建立了全基因盼高密度遗传多态性图谱。对该区域群体遗传学分析发现，整个基因区域离多态性具有跨物种分布特点，表明受到了平衡选择作用。系统发育分析以及连锁不平衡分析都表明在进化过程中发生了频繁位点内重组。在等人提出理论基础上更换理论定义对象，以及结合重组模型，我们很好地解释了小片段重组如何解决了平衡选择和负选择在进化过程中带来冲突。三个位点对比分析发现在第二和第三内含子为重组热点，进步支持了我们观点。对三个经典位点多态性分析比较发现，作为个相对独立个体在启动子调控元件和上与截然不同。首先启动子整体多态程度与差异不大，但位点集中在调控元件上，并且存在完全不同分布模式。其次，作为中最保守区域之，中大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究却在中显示高度多态性。参考其他研究对与其他等位基因型表达差异以及等人对转录后稳定性研究结果，对三个位点在该区域序列比较分析，我们认为通过影响稳定性，协同调控元件在类基因表达中起到重要作用。同时我们选取了不同家系等位基因进行系统发育分析，结合各等位基因在人群中分布频率，验证了所提出启动子决定等位基因型进化命运观点。而具体通过什么途径影响基因稳定性，需要我们更深入地研究。关键词，多态性，调控元件，内含子，单倍型，分子进化中山大学硕士学位论文基瞬多态性及分子进化研究汀，田中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究，Ⅳ中山大学硕士学位论文基因多态性及分子进化研究引言二十世纪四十年代已经发现，鼠近交系之问进行正常组织移植排斥由分布在不同染色体上多个基因所决定。并证实这种捧斥实际上是种免疫反应，其中将诱导强烈而迅速排斥反应抗原称为主要组织相容性抗原，编码这种抗原基因群称为主要组织相容性复合体，张卓然，。目前已知脊椎动物包括鸟类鱼哺乳动物等都有系统，但尚未在比软骨鱼更古老脊椎动物中克隆到基因。不同动物在组成结构和功能及分布上彼此相似，但命名各不相同。其中，人类又称为人类白细胞抗原系统分为经典类二类和非经典三类区域。其中经典类区域有包含了三个经典基因和些非经典基因与假基因。和都具有重要免疫功能，其中更是全基因组中多态性最高位点之。这些特点使其自从被发现以来直是区域研究热点。广泛应用于基因功能与进化，器官移植研究法医鉴定个体识别，疾病相关性研究以及用于民族起源进化迁移融合等人类遗传学研究。长期以来人们根据低水平多态性和细胞膜表达量推测免疫功能有限。，对研究直滞后于其余两个经典类基因研究。但最近不同研究都表明情况并非完全如此,。而对研究大多局限在编码抗原结合槽外显子，更是缺乏完整中国人群数据。因此，本文对全长基因进行克隆分析，建立汉族个体图谱。对两个基因自身特点进行分析。另方面，结合本实验室过去对研究所