输出方格形变之外的非仿射部分，它是用方格对形变张量进行最小二乘拟合后的残差余项，也就是和的属性。

如果不需要可不选以节省时间。

勾选时，可挑选出无效粒子因截断半径内的邻居粒子太少。

该项是默认勾选的，采用参考文件中选中的动画帧作为参考构型。

若勾选，则将采用个可变的参考构型来计算形变矢量。

可以计算形变矢量的增量。

帧偏置控制参考帧和当前帧的时间差，可正可负。

若为负，则参考帧先与当前帧。

注意，当参考帧为负或者超出范围时，将不计算形变矢量。

收集和约化将粒子收集到个空间箱子中，对箱中的粒子进行约化简化操作，比如对箱中的属性值求和平均，或求最大最小值。

箱子的收集方向与模拟盒子的轴平行，可以是维的也可以是二维的。

要进行操作的属性。

约化操作的类型，如求和平均最小最大。

还有个，对第个求和，然后除以各自的体积。

该选项可用于计算由单原子得到的每种箱子的压强或压力。

的准线就像圆柱体的准线。

注意选择单个矢量给出维的网格，的准线将垂直于所选的矢量。

选择两个矢量给出二维网格，准线垂直于这两个矢量也就是平行于第三个矢量。

用有限差分近似方法对数据的阶微分进行数值计算。

该计算只对维网格进行。

它可以用来计算速度分布的微分，得到切变速率。

两个方向上的箱子数目。

键角分析④创建表面网格由修正步骤产生。

位移矢量计算两个不同构型间粒子的位移矢量。

修正通道的输入文件默认设为当前构型变形后的，参考构型初始的由修正器从另外的文件导入。

从当前构型中减去初始构型，得到每个粒子的位移矢量。

算得的矢量保存在属性中，并且可以选择显示为箭头。

也可以用修正观察其幅值。

选择包含初始构型坐标的文件，注意此文件应该包含于当前文件相同的粒子集，因此在使用此修正前不允许删除粒子。

通常此修正应置于处理通道修正通道的开头。

为了计算位移矢量，修正器将去参考构型中寻找相应的粒子。

如果粒子已有独特的，修正器将使用此信息当前构型的粒子映射到参考构型中如果没有，修正器会假定粒子在两构型中按照相同的顺序存储。

计算得到的矢量保存为属性。

该矢量与个附加的显示对象相关联，可以将该矢量渲染为箭头。

默认不激活该显示对象，你要先在修正通道中激活才能显示。

该矢量的外观通过来控制。

参加后面显示板块消除模拟单元的均匀形变。

先对当前模拟单元包括所有粒子进行重标，使之与参考构型相匹配，再计算位移矢量。

这可以有效消除模拟单元宏观的均匀的形变，从而使计算出的矢量只反映模拟单元内部的微观的粒子形变。

假定坐标是未缠绕的。

该选项只对周期性边界条件有影响。

如果勾选，则认为两构型的坐标都是未缠绕的。

如果不选，则会对那些越过了周期性边界的粒子作处理，将它们折算到最小周期内。

如果勾选，则参考文件中选中的动画帧将作为修正参考，用于位移矢量的计算。

这是默认模式。

若勾选，则将采用个可变的参考构型来计算形变矢量。

可以计算形变矢量的增量。

帧偏置控制参考帧和当前帧的时间差，可正可负。

若为负，则参考帧先与当前帧。

注意，当参考帧为负或者超出范围时，将不计算形变矢量。

中心对称参数该修正计算每个粒子的中心对称参数，见，。

在固体系统中，是测量单个原子周围局部无序状态的有效手段，可以用于辨认原子是处于理想晶格当中，还是处于缺陷当中例如错位或者断层，抑或是处于表面。

计算的算法也用在中。

计算时，需要给定邻居数目。

这与要处理的晶格类型有关，若是或，则应分别设为和。

更般的情况下，该参数可设为正的偶数。

如果原子处于理想晶格的格点上，那么其为。

受到小的热力学扰动时，它比大点。

当缺陷的对称性被破坏，或者原子处于表面时，它则变为个很大的正数。

注意此修正需要访问所有粒子，因此应该放在处理通道的开头，或者任何删除操作之前。

团簇分析此修正将粒子体系分成不相连的几个部分，每个粒子都将获得个团簇编号。

输入输出个团簇定义为这样簇粒子，其中各个粒子都处于个或者多个其他粒子的截断距离之内。

如果个粒子截断距离之内没有邻居，那么它就是个单粒子团簇。

该修正将分组的结果写入属性中，它记录了每个粒子所属的团簇的编号。

该值在之间，为团簇数目。

判断两粒子是否处于个团簇内的邻近距离，超过它则视为不邻近。

共近邻分析，图时，它要考虑粒子半径。

不选，则计算单分散图，它与粒子尺寸无关。

未选择的粒子视为不存在。

⑭缺陷分析显示板块显示对象将影响数据的渲染。

板块列出了当前激活的对象。

粒子由渲染，它显示了控制粒子外观的各个参数。

另外，还有些单独的显示对象，例如当通道中添加了个修正步骤，你会发现板块下出现了额外的入口，它们表示其他的可以调整的可视化元素，如键位移矢量。

去掉勾，可以关闭单个的显示。

显示设置明暗，为三维阴影，为二维阴影。

最快，粒子没有深度粒子有深度，密集原子间光线的相互影响也能计算这两个只显示面向观察者的面。

显示真实的球形，计算每个像素中光线与球之间的相互影响。

在时，根据粒子数目自动选择，少于，个粒子，用多于，个用。

在最后输出图片时，不论粒子数多少，均为模式。

球形和立方，若选了，则分别变为圆形和方形。

设置粒子尺寸。

只有当粒子没有半径属性并且单个粒子类型的半径未被指定时才可用。

盒子的显示点，下方出现其属性栏，去掉的勾，则渲染时主窗口不显示外围的框形线，此时其他窗口仍显示外框线若直接去掉前的勾，则全都不显示。

粒子的显示点，下方出现的栏目。

为明暗模式，有普通三维平面两种。

为渲染质量，可选低中高和自动四档自动与中差不多有球形和方形。

和的区别在于，是把面向观察者的表面抹平，球形变为圆片，方形变为方片则是立体的方块，不因视角的改变而变。

该显示对象负责将矢量显示为箭头形标示。

比如由修正得到的位移矢量。

阴影模式，为三维，为二维箭头。

采用渲染方法来显示箭头。

标定因子，控制箭头的长度，默认为箭头线的直径。

反转箭头的头尾方向。

将箭头栓在粒子所在的位置。

箭头颜色，目前只支持用统的颜色显示箭头。

渲染标签在修正通道上方的标签栏中，选择标签，可以进行图像和动画的输出。

渲染设置此面板可以调整输出图像的参数，如分辨率和背景颜色。

设置好后，点按钮，即开始渲染。

会弹出个新的窗口，显示进程。

有两种渲染引擎，默认为硬件加速的，实时显示用的就是它。

因此它是很快的，并且产生的图像就是你所看到的。

另种为软件加速的光学追踪引擎，它支持阴影和周围环境遮蔽的效果。

它的缺点是用时较长。

制作动画先在面板中选择，再设置文件名和格式。

内置程序可以合成和格式的动画，你也可以输出单独的图片，再自己合成为动画。

播放速度可以去动画工具条中点开，在对话框中选择。

调整视图在窗口中看到的和实际输出为图片的可能有所不同，此时可在窗口中点左上方的标题栏，出现视图窗口，选择选项，预览图像。

还可以选择摄像头按特定的视角输出。

超光速渲染器基于光线追踪渲染器，可以用周围的封闭光线来渲染场景。

参数抗失真采样数。

光线追踪器可以进行超级采样，计算每个输出像素的多条光线。

按定角度照射平行光。

头影，当前版本的，在时，不能关掉阴影，此时可以关掉光源。

模拟各个方向的散射光，就像室外的阴天。

采样数采用的是蒙特卡罗方法，更高的采样数导致更均匀的明暗，但计算时间更长。

保存为图片和动画二者均可在渲染标签下完成。

帧数与格式并没有直接的关系，可以选多帧输出多个图片，也可以选帧输出动画。

决定输出动画还是图片的，是保存的格式。

点下的，弹出对话框。

选择或输出图片格式，选择等则输出动画。

确定格式和名称后，自动打勾。

输出图片先在窗口下方的工具条中选好要渲染的单帧。

再选择要输出的窗口主窗口，当边框为黄色时说明已选中。

可以同时预览多个窗口，彼此并不冲突。

选好后，在中选择。

中背景默认为白色。

确认文件格式和名称后，最后点，即完成渲染。

关闭窗口，去文件夹目录下查看生成的图片。

输出动画选择全部帧或者指定帧。

选择主窗口，文件格式和名称，最后，等待渲染。

输出前可以利用工具条预览动画效果。

输出帧输出多帧最后点文件名称和格式，决定输出的是图片还是动画叠层标签和监视程序标签坐标轴颜色条等均视为粒子和盒子之外的叠层。

点击标签。

坐标轴点，即添加三坐标轴图标。

点中，下方出现属性栏。

中更改可以对三坐标整体进行水平移动中可以更改三个坐标轴的颜色方向，还可以添加第四条轴。

颜色条点，即添加颜色条。

点中下方出现的属性栏，中更改，可以对颜色条整体进行竖直移动。

中，输入颜色所代表的属性名称，确认，即可更新。

如果想了解当前帧些粒子属性或测量它们之间的距离角度，可使用监视程序。

更改标签到，点击。

脚本编辑提供了脚本界面，可以实现多种分析和可视化操作。

当有大量输入文件需要处理时，这将十分有用。

该程序附带了个整合的翻译器，可通过脚本控制该程序以及使用它的函数。

这个脚本界面提供了大部分功能的程序化途径，包括导入导出数据文件修正渲染图像和动画。

如果你对语言不熟，你可以从网上找些教程或书籍。

支持语言标准。

该界面的文档有单独讲述位版的不支持，若要使用该功能，请下载位版。

，，，，，，坐标数，⑩直方图可用于显示属性量的分布，可以选择粒子和量值的范围。

选择要计算的属性。

控制生成的直方图的分辨率。

若勾选此项，则对所有满足此范围的粒子作图。

⑪辨认金刚石结构此修正可寻找体心立方或六边形金刚石结构。

分析每个粒子两层内的邻居粒子，以确定局部结构的类型，所得结果保存在属性中，属性的类型用个整数来标记。

类型编号类型名描述其他未知的配位结构，不属于以下任何种典型结构。

第层和第层邻居原子均按照体心立方金刚石格点排布。

第层的个邻居原子均按排布，但是第层中至少有个不是。

类型编号类型名描述中心原子和第层邻居原子均为结构，但是第层至少有个丢失或者不在晶格位置上。

第层和第层邻居原子均在六边形金刚石晶格上。

第层个原子均在格点上，但是第层中至少有个不是。

中心原子和第层邻居原子均为结构，但是第层至少有个丢失或者不在晶格位置上。

中心原子绿色第层最近邻居蓝色第层邻居的邻居黄色。

原理为了区分六边形和金刚石形结构，所用到的结构辨认方法考虑了第二层邻居粒子。

该方法可以认为是通常的共邻近分析的扩展版，后者通常用于区分，和结构，但是不适用于金刚石结构，因为第层邻居之间没有共同的邻居，而第层又不能很好地区分开来。

这些问题是这样解决的首先辨认出中心原子的第层邻居原子，再辨认这些邻居原子各自的邻居它们的第层邻居，而这个原子就构成了中心原子的第层邻居。

最后，计算中心原子和这个原子的图谱，如果算出的图谱是按排布的，那么中心原子就标记为原子。

如果符合结构，则中心原子标记为原子。

请注意，以上是最近开发的方法，还未发表，也就是说目前还无法引用。

如果你打算在你的工作中使用该方法，请联系的作者。

⑫作散点图可以作任意两属性之间的散点图。

可以选择些范围内的粒子。

选择横轴和纵轴的数值范围。

⑬泰森多边形分析以粒子位置为中心作图，默认输出两个量的体积和面数。

因为面数等于最近的粒子数，因此后个量也叫做坐标数。

作为可选项，此修正还可以计算每个的指数。

它是由若干个整数组成的矢量数组，各整数依次表示中有条边的面的个数条边的面数，条边的面数。

例如，二十面体对应的指数矢量为，描述了个由个边形组成的多面体。

除了第个整数外，其他均为，意即没有哪个面不是条边的。

可以在修正中用布尔表达式挑选出这样的二十面体结构因为没有哪个面的边数是少于的，因此和恒等于注意，此修正只计算模拟盒子内部不是整个空间的图，边界上的将被截掉周期性边界例外。

在计算内部粒子的单元时会考虑外部粒子，但是不会对外部粒子计算其单元。

有两种方法计算