文档格式 (外文翻译)早期和晚期人体恶性肿瘤中循环肿瘤DNA的检测(外文+译文) ㊣ 精品文档 值得下载

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突变碎片平均数量大于被中类似水平。


中单碱基替换与重排比较我们也感兴趣于比较同患者循环中两种不同种类碎片基因学改变。


尽管这项研究中实际问题使我们不能鉴别所有患者中基因重排见讨论,但在名患者中肿瘤特异性重排和肿瘤特异性点突变被识别表。


个例外是名在有着循环点突变患者,这名患者肿瘤中重排鉴定不能在她血浆中被识别表。


有着点突变循环碎片绝对数量相对重排是高度相关图相关系数.。


然而,在四名病人体内,含有重排循环碎片数量大于十倍含有待测点突变循环碎片数量表,这现象原因是我们选择用个方法也可以使我们直接比较两种在循环中发现最常见肿瘤特异性遗传学变化形式单基因替换和重排。


最直接应用之被术语化为“液体活组织检查”.在研究和临床实践中,很难获得用于基因分析肿瘤样本。


些肿瘤比如肺癌只有通过细针穿刺才能得到并不足够用于基因型分析材料,反之在其他情况下从不同医疗中心获取样本会很有挑战性或者很耗时.此外,旦个靶向治疗用于有着多种转移瘤病人,临床医生可以经常寻找复发早期证据或者潜在抗性机制,这是种液体活组织检查特别有价值情况。


例如,他们可以提供全部肿瘤负荷暂时性测量值和识别治疗期间上升特异性基因突变,.尽管液体活组织检查方式证明是有前途,但它相关于传统肿瘤活组织检查敏感性和特异性并没有在个大临床相关群组中被评估。


这里,我们在使用表皮生长因子受体抑制剂结肠癌患者身上评估这方法特异性和敏感性。


我们也使用液体活组织检查方法在最初应答表皮生长因子受体抑制剂患者身上鉴别负责复发基因突变。


总来说,对测量用于评估有不同癌症患者,这些研究提供了其潜在价值与局限丰富信息。


结果有着转移癌患者我们从评估来自种不同组织类型例转移癌和位有着原发性脑肿瘤神经胶质瘤和成神经管细胞瘤患者开始这项研究。


原发性脑肿瘤被包括在这项评估内是因为尽管它几乎不转移但它通常是致命。


我们同样也包括了例额外案例,由三期卵巢癌和肝细胞癌组成,这个特别评估是因为四期案例非常稀有并且在这两种癌症中三期疾病更具有晚期肿瘤代表性。


这些患者临床特征被总结为表。


靶向测序,外显子测序或全基因组测序被用来识别癌症中基因突变,就像辅助材料及方法中描述那样。


在这些晚期案例中,至少个基因改变个点突变例或者基因重排例被发现在每个癌症研究者中表。


除了在,和众所周知体细胞中这些已知热点基因中发生基因突变子集外,通过评估同患者非肿瘤性细胞,所有其他基因突变被证明也发生在体细胞中。


通过三种数字化方法中种进行评估见补充材料和方法。


当应用于同血浆样本,这些方法产生了可比较结果图并且从血浆提纯中全部可以探测到个突变模板。


每个病人可用血浆数量列在表中。


大部分有着脑外实体瘤被研究患者被检测到.然而,有着可探测部分患者因肿瘤种类而异似然比检验如图和图所示,大部分有着三期卵巢癌,肝癌和胰腺,膀胱,结肠,胃,乳腺,肝脏,食道和头颈部转移癌,以及成神经细胞瘤和和黑色素瘤患者有着可探测水平。


相反,少于有着成神经管细胞瘤或肾脏,前列腺,甲状腺转移瘤患者和少于百分之十有着神经胶质瘤患者有可探测水平。


有着图描述肿瘤类型患者数量是很少,这限制了不同类型肿瘤间比较统计学意义,但有着神经胶质瘤低或高水平,表患者相比有着胰腺,结肠,乳腺,食管胃或者卵巢转移癌患者更低可能有图和图。


尽管在大部分有着转移癌患者中是可检测,但浓度因病人而异,甚至是在那些同种类癌症中图和表。


有些这种变率是因为在不同肿瘤中化验基因拷贝数是不样。


举例来说,如果患者肿瘤中待测基因放大倍,然而患者肿瘤中待测基因呈现正常拷贝数,那么患者量预期是患者倍见“中单碱基替换与重排比较”。


然而,在只有非放大基因例如被评估癌症中观测到很大程度变异性。


有着局部疾病患者我们下步评估有着局部疾病患者体内,就是说,在样本采集期间没有临床上或者放射线检查远端转移证据。


在有着所有被评估种类局部癌症名患者中,患者体内发现可探测水平名患者中名,表。


这部分低于来自所有肿瘤类型有着充足可用样本转移性疾病患者乳腺,结肠,胰腺和胃食管图模型拟合及分层卡方检验.观测值。


可检测水平出现在到有着这四种局部肿瘤患者中以及到有着这四种转移性肿瘤患者中图。


有着可探测水平患者比例不同也与病程有关期任何癌症患者有着可探测,然而期癌症病人有可探测比例各自是,和图,萨默斯指数等级相关.。


同理,血浆中浓度随着病程上升。


比较和这些实验中,孤立于离心分离后得到血液中细胞区室,这些颗粒包括和白细胞,血小板,和其他细胞成分。


在每个样例中,肿瘤全基因组测序被用于鉴别体细胞重排。


基于试验被用于识别相同患者那些血液颗粒或者血液上清液血浆中重排。


这些实验可以在肿瘤特异性重排下进行但不能在肿瘤特异性点突变下进行,原因见讨论。


我们没有识别到任何可探测但不存在案例。


然而在许多可被检测到情况下中个,没有可在相同实验中被探测表.此外,在和水平都可检测三个案例中,血浆中突变碎片平均数量大于被中类似水平。


中单碱基替换与重排比较我们也感兴趣于比较同患者循环中两种不同种类碎片基因学改变。


尽管这项研究中实际问题使我们不能鉴别所有患者中基因重排见讨论,但在名患者中肿瘤特异性重排和肿瘤特异性点突变被识别表。


个例外是名在有着循环点突变患者,这名患者肿瘤中重排鉴定不能在她血浆中被识别表。


有着点突变循环碎片绝对数量相对重排是高度相关图相关系数.。


然而,在四名病人体内,含有重排循环碎片数量大于十倍含有待测点突变循环碎片数量表,这现象原因是我们选择用以提供有着转移性癌症患者治疗方法,预测以及预后方面信息。


如图所示,有着相当低水平转移性患者比高水平患者寿命显著延长,并且在浓度和存活率间有着显著相关性。


个存活率与浓度间类似相关性最近在晚期乳腺癌患者中被报道。


尽管这些优点使得它对于监控患者是很有前途,但也有潜在局限性。


特异突变被原发性癌症评估所界定,对于患者管理既需要投入时间也需要费用。


将来这会变得阻碍更小,因为更多癌症患者将会对他们肿瘤进行遗传学分析以便于指导治疗决定。


这些过去常常用于指导治疗遗传学改变同样可被用于分析。


涉及监控晚期癌症患者实用性个更严肃问题是,使用还是生物标记,。


方面,患者和他们内科医生焦急地想尽快知道疾病是否进展。


设想研究经常是无告知性或者迟钝反应疾病进展。


再设想受试患者受到辐射,但是监测是非侵入性。


另方面,尚未显示使用任何生物标记监控晚期癌症患者在临床上有着类似于对心理效益不利。


在转变为临床症状前知道进展或应答可能并不会延长生存或提高生命质量。


方法论比较血液中有两类可获得肿瘤和,两种类型遗传学改变可以在任类型中很容易被评估点突变和易位。


早先比较与研究得到了混合结论。


举例来说,个小组得出出现少于结论这组使用体现最高技术水平方法去探测但是并没有使用高敏感性方法去探测。


第二组得出结论是比更经常出现这组使用种灵敏方法去分析但是使用了几乎不敏感方法去探测。


最近以来,在三名小儿成神经细胞瘤患者中两位发现水平远高于。


为了进步研究这个问题,我们对来自有着典型实体瘤患者同血液样本同时评估与。


我们仅把细胞性成分与血浆分离并鉴定细胞部分或细胞类似物,分别,这其中肿瘤特异性重排可以被鉴定。


因为我们没有试图事实上从普通白细胞计数中分离肿瘤细胞,关系到纯化效率技术问题被排除。


来自和间比较并不能简单地通过点突变来展现,因为基于实验点突变背景水平很高。


这背景妨碍了每十万细胞少于个水平点突变探测。


因为每毫升血液中出现有几百万普通细胞但只有几个,需要种更灵敏技术。


重排探测很适合这任务,因为据显示在数百万野生型模板分子中个突变可以被稳定探测错误并不会形成特定重排。


使用患者特异性重排作为工具,我们能够显示水平总是高于。


在名患者中人水平非常高但是没有任何可以被检测到。


这并不意味着相对于更适合于检测或监控癌症。


不如说最理想技术取决于许多其他因素,包括费用与生产力,这样探测有优势。


然而,这些比较确实显示绝大多数并不是直接从中产生。


因为半衰期很短小于.小时,事实上比短,我们工作显示血浆中变异分子并不是从中产生。


另个比较兴趣点关注于易位和点突变。


我们结果表显示研究案例中每毫升血浆碎片中易位和点突变数量是相似。


然而,在个案例中个,个点突变在血浆样本中被探测到但是所研究易位是缺失。


这现象可能原因是点突变非常早发生于肿瘤形成驱动基因中,反之重排是亚克隆性,可能并没有贡献于肿瘤发展。


在四个其他案例中,重排被探测到高于点突变十倍水平表。


在这些案例中,重排被发现是体细胞扩增基因部分。


从个实际角度出发,这些数据显示如下结论通过使用出现扩增子重排来探测遗传学改变可达到最大灵敏度。


许多肿瘤,尤其是有着这些扩增子晚期肿瘤使得使用低覆盖率基因组测序方法来探测是非常简单。


正如与间比较样,这较高灵敏度并不意味着临床应用上重排比点突变更受欢迎。


总结作为总结,我们证明了对于各种不同种类实体瘤和临床主治可被用作为可行生物标记。


这生物标记临床功用,危险以及好处来自于我们对水平知识掌握,只能通过合适数量患者纵向研究来探索,正如当前进展中.这里报道研究为将来类似研究打下了基础。


中文字出处,早期和晚期人体恶性肿瘤中循环肿瘤的检测如何发展无创的方式去发现和监视肿瘤直是肿瘤学中的个主要挑战。


我们在位有着不同种癌症的患者身上采用基于数字化的技术去评估肿瘤循环探测癌症的能力。


个方法也可以使我们直接比较两种在循环中发现最常见肿瘤特异性遗传学变化形式单基因替换和重排。


最直接应用之被术语化为“液体活组织检查”.在研究和临床实践中,很难获得用于基因分析肿瘤样本。


些肿瘤比如肺癌只有通过细针穿刺才能得到并不足够用于基因型分析材料,反之在其他情况下从不同医疗中心获取样本会很有挑战性或者很耗时.此外,旦个靶向治疗用于有着多种转移瘤病人,临床医生可以经常寻找复发早期证据或者潜在抗性机制,这是种液体活组织检查特别有价值情况。


例如,他们可以提供全部肿瘤负荷暂时性测量值和识别治疗期间上升特异性基因突变,.尽管液体活组织检查方式证明是有前途,但它相关于传统肿瘤活组织检查敏感性和特异性并没有在个大临床相关群组中被评估。


这里,我们在使用表皮生长因子受体抑制剂结肠癌患者身上评估这方法特异性和敏感性。


我们也使用液体活组织检查方法在最中文字出处,早期和晚期人体恶性肿瘤中循环肿瘤检测如何发展无创方式去发现和监视肿瘤直是肿瘤学中个主要挑战。


我们在位有着不同种癌症患者身上采用基于数字化技术去评估肿瘤循环探测癌症能力。


我们发现有着晚期胰腺,卵巢,结肠,膀胱,胃,乳腺,黑色素,肝细胞或头颈部癌症患者体内是可探测,但是只有不到百分之五十患有原发性脑,肾,前列腺或甲状腺癌患者中可探测到。


在有着局部肿瘤患者中,结肠癌,胃癌,胰腺癌和乳腺癌可探测率分别是和。


经常出现在没有循环肿瘤细胞患者中,暗示这两种生物标记物是不同存在。


在有着名转移性结肠癌患者组单独实验对象中,我们发现有临床相关基因突变可探测率是.,且特异性是.。


最终,我们在位对治疗有着客观响应但随后复发患者身上对是否能够提供表皮生长因子受体抑制剂潜在抗性机制线索进行评估,这些患者中人在涉及促分裂原活化蛋白激酶通路基因中发展出个或更多突变。


总之,这些数据暗示是个明显适用,敏感和特异可被用于在有着多种不同癌症患者身上进行临床和研究目生物标记。


简介在美国,癌症今年就会发生在多于万个体身上,但是个经过临床证明可以用来帮助指导病人管理循环生物标记只适用于他们中少部分,甚至是在广泛转移设置中.尽管基于血浆蛋白生物标记比如癌抗原,癌胚抗原和前列腺特异性抗原通常用于这目,但这些蛋白也存在于不患癌症个体血浆中,虽然浓度较低.此外,在晚期癌症患者体内这些标记并没有被发现相当大程度增加,。


随着负责人体癌症产生和发展基因改变发现,寻找新代生物标记成为了可能。


随着源自近来癌症基因测序研究基因信息汇总,现在已知几乎每种癌症都有体细胞基因改变。


这些改变包括单碱基替换,插入,删除和易位后者包括那些与基因融合,基因扩增或杂合性缺失产物。


这些体细胞突变以可忽略频率发生在普通细胞群体中并因此提供从生物学视角上坎精巧特定生物标记。


有两种肿瘤可以在循环中被非侵入性评估无细胞肿瘤循环和循环肿瘤细胞,。


由与细胞或细胞碎片无关核酸小碎片组成。


相反,展现着完整,经常是存

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