媛，董晓静，吕娅，等拟南芥分子生物学研究进展中国农学通报，綦洋，王柬钧，桑园园，等大白菜基因家族的鉴定与生物信息学分析江苏农业科学，袁明月，楼轶，张竞，等各个成员的级结构元件组成含量大小排列顺序都表现为无规则卷曲螺旋延伸链转角，级结构的图像与级结构预测的结果相致。阿拉伯岩芥基因家族与拟南芥白菜玉米小麦等都有较近的亲缘关系，其中阿拉伯岩芥成员与拟南芥成员和小麦成员的亲缘关系最近，与印度水稻的亲缘关系最远。阿拉伯岩芥与拟南芥的亲缘关系最近，可能与其同属于十字花科有关，而与印度水稻的亲缘关系最远，可能与它们分别属于单双子叶植物有关。该研究结果为进步研究阿拉伯岩芥基因家族在其生长发育过程中的生物学功能提供了定的参考依据。参考文献汤宾，李玉军，赵燕，等十字花科植物个物种基因的系统进化分析湖南农业大学学报自然科学版，邓浪，沈兵琪，王连春，等红阳猕猴如拟南芥为个，玉米为个，甘蓝为个。但是不同物种之间的基因具有定的保守性，都含有特定的结构域，。该研究显示阿拉伯岩芥基因编码蛋白个成员都含有保守结构域，其中个成员有个保守结构域，其余均只有个保守结构域。植物为了克服生长发育中不利影响，自身会在体内形成各种应答机制，有些蛋白会在非生物胁迫下作为保护因子调控植物细胞的稳定，进而提升其抗逆性，。该研究中阿拉伯岩芥蛋白整体成员表现为亲水性蛋白，这可能是利于阿拉伯岩芥增强抗逆性的因素。和元件都已被证实参与了或其他转录因子的结合。研究证实，中的个转录因子与苜蓿和拟南芥的抗旱性都有关。基因序列对比表明阿拉伯岩芥基因序列含基于生物信息学角度进行阿拉伯岩芥基因家族研究遗传学论文稻的亲缘关系最远。从十字花科分类的角度分析，阿拉伯岩芥与拟南芥亲缘关系最近，可能与其同属于十字花科有关，但是与甘蓝的亲缘关系最远从双子叶植物与单子叶植物分类分析，阿拉伯岩芥亦是与拟南芥和小麦亲缘关系最近，然而与印度水稻的亲缘关系最远，可能与它们分别属于单双子叶植物有关图。图蛋白系统发育树图多物种基因系统进化树讨论与结论郭慧等对甘蓝转录因子的研究分析表明甘蓝蛋白质结构为不稳定性蛋白。该研究中阿拉伯岩芥基因编码蛋白之间存在差异性，且为不稳定蛋白，这与郭慧等对甘蓝蛋白结构研究结果相同。谢藤等对新疆紫草转录因子进行生物信息学分析表明其亚细胞定位存在于细胞核，不存在跨膜域，不属于白图。其余成员均无信号肽，为非分泌蛋白。阿拉伯岩芥基因编码蛋白的跨膜结构域分析对阿拉伯岩芥蛋白序列的跨膜结构域分析发现该基因家族的蛋白成员有跨膜现象，尤其是成员可以看到从第个氨基酸到第个氨基酸之间有个明显跨膜区，但是并没有形成跨膜域，所以推测成员不属于跨膜蛋白。其余的成员均没有跨膜区域，因此，基因编码蛋白的个成员都不属于跨膜蛋白。基于生物信息学角度进行阿拉伯岩芥基因家族研究遗传学论文。整体共分为个组，组共个基因成员，阿拉伯岩芥成员有个，拟南芥成员有个，其中拟南芥成员是进化速度最快的个阿拉伯岩芥成员与其处在同地位，亲缘关系最近。组共有个成员，阿拉伯岩芥成中螺旋在蛋白级结构中占比最多的是成员，占比最少的是成员延伸链在蛋白级结构中占比最多的是成员，占比最少的是成员转角在蛋白级结构中占比最多的是成员无规则卷曲在蛋白级结构中占比最多的是成员，占比最少的是图。对阿拉伯岩芥蛋白的级结构预测分析发现，所有成员都以螺旋较为突出，且可分为个组，其中组含有个成员，组含有个成员，其余各组均含有个成员。级结构中含有螺旋元件最多的是组组组组，含有个螺旋元件最少的是组组图。疏水性亲水性分析表明蛋白成员中最大疏水性数值在，最大应用在线工具软件对阿拉伯岩芥基因编码蛋白进行氨基酸数分子量等电点等理化性质的分析利用在线软件。信号肽和跨膜结构域预测。利用预测分析蛋白是否存在信号肽，是否属于分泌蛋白利用对其进行跨膜结构域预测分析，。阿拉伯岩芥基因编码蛋白的磷酸化位点预测分析对阿拉伯岩芥基因编码蛋白的氨基酸序列的磷酸化位点分析发现，在基因编码的蛋白个成员中共含有个丝氨酸磷酸化位点，个苏氨酸磷酸化位点，个酪氨酸磷酸化位点。其中成员丝氨酸磷酸化位点最多，为个，最有可能的磷酸化位点是位的丝氨酸，数值为成员苏氨酸磷酸化位点最多，为家族成员，印度水稻家族成员，甘蓝家族成员，白菜家族成员的蛋白序列，用于后续的生物信息学分析。方法理化性质分析及亚细胞定位。基于生物信息学角度进行阿拉伯岩芥基因家族研究遗传学论文。级结构的预测利用利用进行级结构预测，通过两者预测以了解蛋白质的结构组成。保守基序和系统进化树建构。利用软件中方法构建进化树，其中进行次分析，以使得分枝的结果更加全面可靠利用分析保守基序。以此对基因的亲缘关系进行探究，。鲜见关于阿拉伯岩芥基因家族生物信息学方面的报道。该，数值为成员酪氨酸磷酸化位点最多，为个，最有可能的磷酸化位点是位的丝氨酸，数值为成员的磷酸化位点总数最多，为个成员和的磷酸化位点总数最少，为个。整体成员数据分析表明蛋白主要是通过在丝氨酸位点进行磷酸化来实现功能的表。表阿拉伯岩芥基因编码蛋白的保守结构域数目及位臵图阿拉伯岩芥基因编码蛋白的保守结构域分析阿拉伯岩芥基因编码蛋白的级结构和级结构预测分析对阿拉伯岩芥蛋白的级结构和级结构预测分析表明，蛋白的级结构都以无规则卷曲为主，各个成员的级结构元件组成含量大小排列顺序都表现为无规则卷曲螺旋延伸链转角。其中螺旋在蛋白级结构中占比最多的是成员酸亲水性最强，在成员上第位的苯丙氨酸疏水性最强，而就整体而言，亲水性峰值相对疏水性峰值较多，较密集。因此，蛋白表现为亲水性，可认为蛋白为亲水蛋白表。表阿拉伯岩芥基因编码蛋白序列的特性分析阿拉伯岩芥基因编码蛋白的信号肽分析对基因编码蛋白的信号肽进行预测分析发现，值最大切割点在第个氨基酸位臵，分值为，综合剪切点分值值最高值在第个氨基酸位臵，分值为，信号肽最大分值值在第个氨基酸位臵，为，因此判断成员有信号肽，属于分泌性蛋白图。其余成员均无信号肽，为非分泌蛋白。阿拉伯岩芥基因编码蛋白的跨膜结构域分析对阿拉伯岩芥蛋白序列的跨膜结构域分析发现该基因家族的蛋白成员蛋白家族研究进展及生物信息学分析分子植物育种，唐跃辉，包欣欣，王健，等小桐子基因家族生物信息学与表达分析江苏农业学报，王雁，王小贝，陈海江，等桃多肽受体基因家族的生物信息学及表达分析园艺学报，袁梦如，杨杨，张磊，等沙柳基因克隆生物信息学及组织特异表达分析分子植物育种，王丽珊拟南芥和水稻基因家族的生物信息学分析闽西职业技术学院学报，郭娟，彭秋菊，佘明明，等辣椒生育酚环化酶基因克隆和生物信息学分析分子植物育种，阮先乐，张杰，张福丽，等甘薯基因家族的生物信息学分析分子植物育种，谢腾，王升，周良云，等新疆紫草转录因子的电子克隆和生物信息学基于生物信息学角度进行阿拉伯岩芥基因家族研究遗传学论文研究利用生物信息学方法对阿拉伯岩芥基因编码的蛋白质进行分析，预测蛋白的理化性质亚细胞定位保守结构域亲水性疏水性信号肽跨膜结构域磷酸化修饰级结构级结构和系统进化等，以期为进步研究阿拉伯岩芥的生物学功能以及调节机制奠定基础。材料与方法材料通过植物转录因子数据库，查找并下载所有关于阿拉伯岩芥基因蛋白序列和拟南芥基因蛋白序列，以及穗短柄草家族成员，玉米家族成员，小麦家族成员，印度水稻家族成员，甘蓝家族成员，白菜家族成员的蛋白序列，用于后续的生物信息学分析。方法理化性质分析及亚细胞定位。基于生物信息学角度进行阿拉伯岩芥基因家族研究遗传学论文量等电点等理化性质的分析利用在线软件。信号肽和跨膜结构域预测。利用预测分析蛋白是否存在信号肽，是否属于分泌蛋白利用对其进行跨膜结构域预测分析，。鲜见关于阿拉伯岩芥基因家族生物信息学方面的报道。该研究利用生物信息学方法对阿拉伯岩芥基因编码的蛋白质进行分析，预测蛋白的理化性质亚细胞定位保守结构域亲水性疏水性信号肽跨膜结构域磷酸化修饰级结构级结构和系统进化等，以期为进步研究阿拉伯岩芥的生物学功能以及调节机制奠定基础。材料与方法材料通过植物转录因子数据库，查找并下载所有关于阿拉伯岩芥基因蛋白序列和拟南芥基因蛋白序列，以及穗短柄草家族成员，玉米家族成员，小麦的生物信息及时空表达分析分子植物育种，吴桂梅，赵小峰，汪瑶，等大鼠单核细胞趋化蛋白基因的生物信息学分析安徽农业科学，张西燕，付玉荣，伊正君结核分枝杆菌蛋白的生物信息学分析中国病原生物学杂志，徐小钦，杜雪，李国勤，等白羽王鸽卵清蛋白关联蛋白基因克隆与生物信息学分析浙江农业学报，冯立娟，尹燕雷，杨雪梅，等石榴查尔酮合成酶蛋白的生物信息学分析山东农业科学，宋雪，秦彩艳，霍金龙，等版纳微型猪近交系克隆亚细胞定位组织表达和生物信息学分析云南农业大学学报，姜铮，王芳，何湘，等蛋白质磷酸化修饰的研究进展生物技术通讯，李杰，杭柏林，宁春妹，等牛源类抗菌肽的，占比最少的是成员延伸链在蛋白级结构中占比最多的是成员，占比最少的是成员转角在蛋白级结构中占比最多的是成员无规则卷曲在蛋白级结构中占比最多的是成员，占比最少的是图。对阿拉伯岩芥蛋白的级结构预测分析发现，所有成员都以螺旋较为突出，且可分为个组，其中组含有个成员，组含有个成员，其余各组均含有个成员。级结构中含有螺旋元件最多的是组组组组，含有个螺旋元件最少的是组组图。应用在线工具软件对阿拉伯岩芥基因编码蛋白进行氨基酸数分子有跨膜现象，尤其是成员可以看到从第个氨基酸到第个氨基酸之间有个明显跨膜区，但是并没有形成跨膜域，所以推测成员不属于跨膜蛋白。其余的成