褐色产物。龙眼果皮活性提高促进类黄酮花色素苷和总酚等酚类物质酶促氧化，发生褐变林艺芬等，。与鸭梨褐变密切相关，其表达受温度和采收时期的影响韩艳文等，。是类多基因控制结构复杂生理功理提供理论依据。探析石榴基因家族鉴定和生物信息学农业生物学论文。亚细胞定位预测石榴基因家族成员在细胞中的位置发现，大部分蛋白定位于细胞质中表。和存在于液泡中，在内质网中分布。定位于细胞核中，为核蛋白。在细胞质和细胞膜中都有分布，存在于细胞质和叶探析石榴基因家族鉴定和生物信息学农业生物学论文存在时，通过催化多种酚类物质，形成褐色产物。龙眼果皮活性提高促进类黄酮花色素苷和总酚等酚类物质酶促氧化，发生褐变林艺芬等，。与鸭梨褐变密切相关，其表达受温度和采收时期的影响韩艳文等，。是类多基因控制结构复杂生理功能多种多样的超家族，在拟南芥中已鉴定出名成员玉米中有名成员，梨中有名成员。目前，石榴异表。基因氨基酸数量分布在到之间，大部分集中在。相对分子量在范围内，与氨基酸数量呈正相关。等电点介于之间，大于的有个，多在碱性范围内，说明石榴蛋白质分子中富含碱性氨基酸。个蛋白的不稳定系数小于，为稳定蛋白，其余不稳定系数大于，为不稳定蛋白。和复制或丢失有关姚丹等，。聚在同亚族的基因，具有相似的保守基序，表明这些成员间的进化关系较近，功能相似黎帮勇等姚丹等，。丝瓜基因在根中高，茎中低，对其果肉褐变起重要的调控作用朱海生等，。目前，石榴基因在不同组织和发育期的表达情况尚不明确，下步将深入分析基因在石榴不同部位及发育过程中的表达水平，解析其与果实本研究通过对石榴蛋白理化性质分析发现，基因家族以碱性氨基酸为主，大部分为亲水性蛋白，稳定性蛋白占。这说明，石榴基因家族成员理化性质存在差异。真核细胞中家族基因亚细胞定位的不同与其功能有关苏亚春等，。石榴基因家族成员主要存在于细胞质中，个别存在于液泡内质网细胞核细胞膜叶绿体和过氧等保守基序。在数据库中对保守基序进行注释表明，基序序列含有结构域，在分子功能上具有过氧化酶活性和血红素结合位点，是典型的过氧化物酶基因家族。表基因家族成员信息讨论是调控园艺植物酶促褐变的关键酶之，其基因家族在植物生长发育和抗逆性，高于拟南芥和梨，这说明石榴基因组复制和多样化高于拟南芥和梨，低于玉米。系统进化树构建石榴基因系统进化树利用软件进行构建，采用法，值设为，支持率低于的节点要去掉，显示各分支长度。石榴基因保守基序分析石榴蛋白保守基序利用在线网站分析在差异图图。聚在同亚族的蛋白保守基序组成相似，说明其成员间进化关系较近。大部分基因家族成员含等保守基序。在数据库中对保守基序进行注释表明，基序序列含有结构域，在分子功能上具有过氧化酶活性和血红素结合位点，少，这说明，螺旋和无规则卷曲在其蛋白级结构中起重要作用，延伸链和转角起定的修饰作用冷非凡等，。系统进化树分析表明，石榴基因分为个亚族，每个亚族基因组成数量存在差异，这可能与基因的复制或丢失有关姚丹等，。聚在同亚族的基因，具有相似的保守基序，表明这些成员间的进化关系较近，功能相似黎帮勇等姚丹等，。丝瓜基因在探析石榴基因家族鉴定和生物信息学农业生物学论文等方面具有重要作用韩艳文等，。是多基因家族组成的酶类，这与植物基因组的广泛复制和多样性有关，。本研究从石榴中鉴定出个基因家族成员，低于玉米，高于拟南芥和梨，这说明石榴基因组复制和多样化高于拟南芥和梨，低于玉米。探析石榴基因家族鉴定和生物信息学农业生物学论文划项目山东省农业科学院农业科技创新工程学科团队山东省农业良种工程南种北繁项目共同资助。保守基序分析利用在线软件预测了个石榴蛋白的保守基序，数量从到个不等，类型存在差异图图。聚在同亚族的蛋白保守基序组成相似，说明其成员间进化关系较近。大部分基因家族成员含个蛋白的不稳定系数小于，为稳定蛋白，其余不稳定系数大于，为不稳定蛋白。和蛋白的脂肪系数大于，为疏水性蛋白，其余蛋白的脂肪系数均小于，为亲水性蛋白。本研究通过对石榴蛋白理化性质分析发现，基因家族以碱性氨基酸为主，大部分为亲水性蛋白，稳定性蛋白占。这说明，石榴基因家。参数设置为最大宽度值为，最小为，模序量小于个，其余参数均为默许。利用数据对保守基序序列进行功能注释。图石榴基因家族系统进化树图石榴蛋白保守基序的分布图石榴蛋白保守基序序列冯立娟，史作亚，杨雪梅，唐海霞，焦其庆，尹燕雷石榴基因家族鉴定及生物信息学分析分子植物育种，基金山东省重点研发计是典型的过氧化物酶基因家族。表基因家族成员信息讨论是调控园艺植物酶促褐变的关键酶之，其基因家族在植物生长发育和抗逆性等方面具有重要作用韩艳文等，。是多基因家族组成的酶类，这与植物基因组的广泛复制和多样性有关，。本研究从石榴中鉴定出个基因家族成员，低于玉米根中高，茎中低，对其果肉褐变起重要的调控作用朱海生等，。目前，石榴基因在不同组织和发育期的表达情况尚不明确，下步将深入分析基因在石榴不同部位及发育过程中的表达水平，解析其与果实褐变的关系，为深入揭示石榴果实褐变机理提供理论依据。保守基序分析利用在线软件预测了个石榴蛋白的保守基序，数量从到个不等，类型成员理化性质存在差异。真核细胞中家族基因亚细胞定位的不同与其功能有关苏亚春等，。石榴基因家族成员主要存在于细胞质中，个别存在于液泡内质网细胞核细胞膜叶绿体和过氧化物酶体中，这说明石榴基因主要在细胞质中起作用，参与其新陈代谢。石榴蛋白级结构以螺旋和无规则卷曲结构为主，延伸链和转角较探析石榴基因家族鉴定和生物信息学农业生物学论文通过对石榴基因家族成员理化性质分析可知，蛋白在氨基酸数量分子量等电点不稳定系数和脂肪系数等方面存在差异表。基因氨基酸数量分布在到之间，大部分集中在。相对分子量在范围内，与氨基酸数量呈正相关。等电点介于之间，大于的有个，多在碱性范围内，说明石榴蛋白质分子中富含碱性氨基酸。能多种多样的超家族，在拟南芥中已鉴定出名成员玉米中有名成员，梨中有名成员。目前，石榴基因家族鉴定及功能方面的研究国内外尚未见报道。随着石榴全基因组测序的完成，从基因组水平上对基因家族进行生物信息学分析成为可能。因此，本研究从基因组水平，利用生物信息学方法鉴定基因家族成员，对其蛋白理化性质级结构亚细胞定位进化绿体中。和在细胞质叶绿体和过氧化物酶体中都能定位到。线粒体细胞骨架和溶酶体等细胞器中没有基因的分布。推测绝大多数蛋白在细胞质中发挥作用。石榴褐变主要是由酶促褐变引起的，与底物酶活性及相关基因的表达有关。当果实中细胞膜系统被破坏，酶与底物区域化被解除，酚类物质被氧化为褐色物质，使组织变色发生褐变基因家族鉴定及功能方面的研究国内外尚未见报道。随着石榴全基因组测序的完成，从基因组水平上对基因家族进行生物信息学分析成为可能。因此，本研究从基因组水平，利用生物信息学方法鉴定基因家族成员，对其蛋白理化性质级结构亚细胞定位进化关系及保守基序等进行分析，解析石榴基因家族特征，为深入揭示调控石榴果实褐变的蛋白的脂肪系数大于，为疏水性蛋白，其余蛋白的脂肪系数均小于，为亲水性蛋白。石榴褐变主要是由酶促褐变引起的，与底物酶活性及相关基因的表达有关。当果实中细胞膜系统被破坏，酶与底物区域化被解除，酚类物质被氧化为褐色物质，使组织变色发生褐变，过氧化物酶作为植物逆境下体内酶促防御系统中的重要成员在果实褐变中也起非常关键地作用。当变的关系，为深入揭示石榴果实褐变机理提供理论依据。结果与分析石榴基因家族成员鉴定及理化性质分析采用和软件分析石榴基因蛋白的结构域，共得到条石榴目标序列。通过人工筛选不同值获得个石榴基因。通过对石榴基因家族成员理化性质分析可知，蛋白在氨基酸数量分子量等电点不稳定系数和脂肪系数等方面存在差氧化物酶体中，这说明石榴基因主要在细胞质中起作用，参与其新陈代谢。石榴蛋白级结构以螺旋和无规则卷曲结构为主，延伸链和转角较少，这说明，螺旋和无规则卷曲在其蛋白级结构中起重要作用，延伸链和转角起定的修饰作用冷非凡等，。系统进化树分析表明，石榴基因分为个亚族，每个亚族基因组成数量存在差异，这可能与基因的