者。因此,筛选医学职称论文。这也证实本研究所筛选出的核心基因能够反映活动性结核。曲婧格等证实,系统性红斑狼疮患者的表达水平明显升高,并与疾病程度及免疫功能密切相关。机体对抗结核分枝杆菌感染也是个免疫过程,从本研究所挖掘的信息来看,的水平应该与结核分枝杆菌的活动程度相关。结论本研究基于生物信息学,从筛选出的核心基因在活动性肺结核患者血液中的表达水平来看,确实能够作为反映结核分枝杆菌活动的指标,将这些标志物结合临床有望提高基于生物信息学方法的活动性结核生物标志物的筛选医学职称论文不能明确感染部位者,由于难以获得病变部位的组织或体液标本得到细菌学证据,因此,诊断仍十分困难。为了提高活动性结核,尤其是肺外活动性结核的诊断效率,本研究以生物信息学方法,分析了健康人群和活动性结核患者的基因表达情况,筛选活动性结核患者特异表达的差异基因。本研究首先将健康人群与活动性结核患者进行对比,提取了者之间的差异基因。为了区别与活动性结核,本研究进步提取了和活动性结核患者之间的差异基因。将两组差异基因对比,并中和是基因连接度较高的几个基因,由此可推测和可能在机体对抗结核分枝杆菌过程中发挥核心作用。是种以细胞为基础的干扰素释放试验,其原理是通过检测被结核分枝杆菌特异性早期分泌靶抗原和培养滤液蛋白分别刺激后释放干扰素的效应细胞,以辅助诊断结核分枝杆菌感染。是基于结核特异性抗原诱导的细胞免疫反应,在感染结核分枝杆菌后均可能获得阳性结果,包括活动性结核和既往结核病史患者对比与与,提取两者中的共表达基因,将提取的基因和与进行对比,剔除其中的重合表达基因,获得目的基因。两组芯片的目的基因中交集的部分基因为本研究的核心基因。利用在线基因注释工具对核心基因进行富集分析和京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析,并运用在线分析工具构建核心基因编码蛋白的相互作用网络。提取芯片中核心基因表达的数据,观察资料与方法数据集获取登陆美国国立生物技术信息中心数据库下载基因表达芯片和。芯片中含有份人类血液标本,本研究选取其中健康人群患者及活动性结核患者全血基因芯片数据为研究对象。芯片中含有份人类血液标本,本研究选取其中健康人群患者及活动性结核患者全血基因芯片数据为研究对象。芯片中含有份人类血液标本,来自例肺结核患者,包括采取方案抗结核治疗前,以及治疗后周个可从无症状发展至危及生命的急性传染病,。根据临床表现的不同,结核感染可分为潜伏结核感染和活动性结核,前者没有任何症状,也没有传染性而后者可有典型的结核症状,包括发热乏力纳差及体质量减轻等。尽管已有许多技术应用于诊断结核病,包括细胞斑点检测结核分枝杆菌及利福平耐药快速检测技术等。但是,目前对于些肺外结核的诊断仍十分困难,尤其是在无明确感染病灶的情况下。因此,寻找新的生物标志物来辅助诊断活动性结核,特别是差异表达的筛选。数据库是个公共功能基因组数据存储库,接受世界各国研究机构提交的基于数组和序列的高通量基因表达数据,。本研究通过分析数据库中结核分枝杆菌感染患者血液基因芯片表达谱数据,旨在寻找新的生物标志物来提高对活动性结核的诊断效率,以期为临床诊断活动性结核提供新的指标。基于生物信息学方法的活动性结核生物标志物的筛选医学职称论文。图核心基因筛选维恩图及富集分析运用在线分析工具对核心基因进行及取芯片中核心基因表达的数据,观察核心基因表达水平在抗结核治疗前后的变化。关键词基因芯片感染活动性结核生物信息学结核病是由结核分枝杆菌复合群感染所导致的种严重危害人类健康的疾病。据世界卫生组织报道,年全球新发结核病患者约万,结核病死亡人数约为万。结核分枝杆菌几乎可以引起身体任何部位的感染,而且,结核分枝杆菌感染后临床疾病谱表现多样,可从无症状发展至危及生命的急性传染病,。根据临床表现的不同,结核感染可分为潜伏结核感染方案抗结核治疗前,以及治疗后周个时间点的全血基因芯片数据。分析方法采用数据库在线数据分析工具对和两组芯片数据进行分析,获取差异表达基因,并应用软件获取目的基因及核心基因。差异基因的筛选条件为差异倍数,。分别对两组芯片中健康人群与活动性结核患者健康人群与患者患者与活动性结核患者这组进行单独分析,获取组,包括与基于生物信息学方法的活动性结核生物标志物的筛选医学职称论文外结核显得尤为重要。基因芯片技术能够快速地检测上万个基因表达水平,已广泛应用于各类疾病基因组水平差异表达的筛选。数据库是个公共功能基因组数据存储库,接受世界各国研究机构提交的基于数组和序列的高通量基因表达数据,。本研究通过分析数据库中结核分枝杆菌感染患者血液基因芯片表达谱数据,旨在寻找新的生物标志物来提高对活动性结核的诊断效率,以期为临床诊断活动性结核提供新的指标。基于生物信息学方法的活动性结核生物标志物的筛选医学职称论文在线分析工具构建核心基因编码蛋白相互作用网络。从蛋白相互作用网络可发现,种基因的编码蛋白能够相互作用,其中是基因连接度最高的基因,其次为和,见图。关键词基因芯片感染活动性结核生物信息学结核病是由结核分枝杆菌复合群感染所导致的种严重危害人类健康的疾病。据世界卫生组织报道,年全球新发结核病患者约万,结核病死亡人数约为万。结核分枝杆菌几乎可以引起身体任何部位的感染,而且,结核分枝杆菌感染后临床疾病谱表现多样与细胞因子的分泌细胞对干扰素的反应适应性免疫和细菌感染反应等相关,而信号通路为固有免疫中的样受体相关信号通路。从以上结果可以发现,机体对抗结核分枝杆菌感染时以样受体相关信号通路为主,涉及机体固有免疫适应性免疫细胞干扰素的反应细胞因子的分泌等。对以上核心基因编码的蛋白构建相互作用网络,结果发现其中的种基因的编码蛋白能够相互作用,其中和是基因连接度较高的几个基因,由此可推测和可能富集分析,结果发现核心基因的主要功能主要集中在及。信号通路分析的唯结果为样受体相关信号通路。见图。图核心基因及富集分析核心基因编码蛋白的相互作用网络分析运用活动性结核,前者没有任何症状,也没有传染性而后者可有典型的结核症状,包括发热乏力纳差及体质量减轻等。尽管已有许多技术应用于诊断结核病,包括细胞斑点检测结核分枝杆菌及利福平耐药快速检测技术等。但是,目前对于些肺外结核的诊断仍十分困难,尤其是在无明确感染病灶的情况下。因此,寻找新的生物标志物来辅助诊断活动性结核,特别是肺外结核显得尤为重要。基因芯片技术能够快速地检测上万个基因表达水平,已广泛应用于各类疾病基因组水与与。对比与与,提取两者中的共表达基因,将提取的基因和与进行对比,剔除其中的重合表达基因,获得目的基因。两组芯片的目的基因中交集的部分基因为本研究的核心基因。利用在线基因注释工具对核心基因进行富集分析和京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析,并运用在线分析工具构建核心基因编码蛋白的相互作用网络。提在机体对抗结核分枝杆菌过程中发挥核心作用。资料与方法数据集获取登陆美国国立生物技术信息中心数据库下载基因表达芯片和。芯片中含有份人类血液标本,本研究选取其中健康人群患者及活动性结核患者全血基因芯片数据为研究对象。芯片中含有份人类血液标本,本研究选取其中健康人群患者及活动性结核患者全血基因芯片数据为研究对象。芯片中含有份人类血液标本,来自例肺结核患者,包括采取基于生物信息学方法的活动性结核生物标志物的筛选医学职称论文部分,使获得的目的基因能同时将活动性结核与和健康人群加以区分。为了使目的基因能够特异性反映活动性结核,避免患者的干扰,本研究分析了健康人群与患者的基因表达情况,获取了者之间的差异基因,并将后者与目的基因进行交集,删除目的基因中重合表达的部分。为了进步提高目的基因的特异性,本研究分别提取了和的目的基因,并将两个目的基因集进行交集,最终获得核心基因个。将个核心基因进行功能富集,结果发现这些核心基因的功能主阳性结果反映体内曾发生过结核分枝杆菌感染的意义更大,而不能有效区分活动性结核或既往结核分枝杆菌感染。是种用于检测结核分枝杆菌复合物的自动化诊断测试,这是种基于的检测结核分枝杆菌基因的方法,还能检测中可能导致利福平耐药的突变。是世界卫生组织推荐的用于结核病快速诊断的方法,它比涂片镜检的灵敏度特异度更高,但是需要特定的组织或体液标本。对于肺外结核,尤其是不能明确感动性结核的诊断效率。但是,由于机体对抗病原微生物时,都有着类似的免疫过程,以上核心基因能否作为区别结核分枝杆菌感染与其他细菌感染的指标,尚待进步验证。参考文献陈裕荷,詹柱,胡鹏,等非酒精性脂肪性肝炎的治疗新尝试脂蛋白脂酶激动剂中华肝脏病杂志,余海浪,马文丽,郑文岭用于基因数据挖掘的基因表达数据库中国生物工程杂志,安覃景,李思思,韩崇旭对中东亚人群胃癌相关易感基因的挖掘国际检验医学杂志,曲婧格,王也,李熙萌,等系统性红斑狼疮患取其中的交集部分,使获得的目的基因能同时将活动性结核与和健康人群加以区分。为了使目的基因能够特异性反映活动性结核,避免患者的干扰,本研究分析了健康人群与患者的基因表达情况,获取了者之间的差异基
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