1、以下这些语句存在若干问题，包括语法错误、标点使用不当、语句不通畅及信息不完整——“.....且不需要预测二级结构，即可直接预测三维结构，从而可以绕过现阶段二级结构预测准确性不超过的限度，因此模建侧链的安装和优化对模建结构进行优化和评估。序列匹配对建立精确的结构模型起着关键作用。般地，序列同源性越差，匹配的准确程度越低，建立的模型精度也越差序列同源性低于的蛋白质难以得到理想的结构方法。同源模建的基本过程包括六部分目标序列与模板序列的匹配根据同源蛋白质的多重序列匹配结果，确定同源蛋白质的结构保守区以及相应的框架结构目标蛋白质结构保守区的主链模建目标蛋白质结构变异区的主链结构和功能。所以利用结构已知的同源蛋白质可以建立目标蛋白质的结构模型......”。

2、以下这些语句存在多处问题，具体涉及到语法误用、标点符号运用不当、句子表达不流畅以及信息表述不全面——“.....利用同源模建方法建立的蛋白质模型是以已知的同源蛋白质结构为基础的，所以这是种基于现代生物学知识的预测中保守的部分搭建出未知蛋白质的结构骨架。它是现在最为成熟的预测方法。蛋白质根据序列同源性可以分成不同的家族。般认为序列同源性大于的蛋白质可能由同祖先进化而来，称为同源蛋白质。同源蛋白质具有相似的分为三大类,同源建模法同源建模法比较建模法是基于知识的蛋白质结构预测方法。这方法目前主要是指同源结构预测。它是在未知蛋白质中有同源结构可以参考的情况下应用的种技术。它可以根据同源结构完整地理解生物信息从到具有生物活性蛋白质的传递全过程，使中心法则得到更完整的阐明......”。

3、以下这些语句在语言表达上出现了多方面的问题，包括语法错误、标点符号使用不规范、句子结构不够流畅，以及内容阐述不够详尽和全面——“.....最终推动生命科学的快速发展。具体的讲，蛋白质结构预测的理论预测方法可酸序列出发预测它的功能构象问题。对蛋白质结构预测进行研究对基础理论和实际应用都有重大意义。在理论上，如果弄清二〇〇年六月十日星期四楚蛋白质级结构是如何决定其高级结构这个基本问题，将会使人们更系统和有效的实验手段，但是这些方法提供蛋白质三维结构的速度还远小于蛋白质序列信息的增长速度。此外，这些方法还存在多种局限。此时，理论模拟与结构预测就显示了重要性。蛋白质结构预测问题就是如何从蛋白质的氨基他们的三维结构即空间构象。与此同时，要设计药物也需要了解与药物相应的蛋白质受体的三维结构......”。

4、以下这些语句该文档存在较明显的语言表达瑕疵，包括语法错误、标点符号使用不规范，句子结构不够顺畅，以及信息传达不充分，需要综合性的修订与完善——“.....当前，虽然射线晶体学技术二维电子衍射等为蛋白质空间结构测定提供了模式，为世纪药学专业的发展提供了强大的动力。随着人类基因组计划和相关测序技术的发展，如今人们已经获得了大量蛋白质的级序列。然而要了解这些蛋白质功能的分子基础，只有氨基酸序列知识是不够的，必须要知道他模式，为世纪预测问题就是如何从蛋白质的氨基他们的三维结构即空间构象。与此同时，要设计药物也需要了解与药物相应的蛋白质受体的三维结构。这是摆在科学家面前的紧迫任务。当前，虽然射线晶体学技术二维电子衍射等为蛋白质空间结构测定提供了模式，为世纪药学专业的发展提供了强大的动力......”。

5、以下这些语句存在多种问题，包括语法错误、不规范的标点符号使用、句子结构不够清晰流畅，以及信息传达不够完整详尽——“.....如今人们已经获得了大量蛋白质的级序列。然而要了解这些蛋白质功能的分子基础，只有氨基酸序列知识是不够的，必须要知道他模式，为世纪药学专业的发展提供了强大的动力。随着人类基因组计划和相关测序技术的发展，如今人们已经获得了大量蛋白质的级序列。然而要了解这些蛋白质功能的分子基础，只有氨基酸序列知识是不够的，必须要知道他们的三维结构即空间构象。与此同时，要设计药物也需要了解与药物相应的蛋白质受体的三维结构。这是摆在科学家面前的紧迫任务。当前，虽然射线晶体学技术二维电子衍射等为蛋白质空间结构测定提供了有效的实验手段......”。

6、以下这些语句存在多方面的问题亟需改进，具体而言：标点符号运用不当，句子结构条理性不足导致流畅度欠佳，存在语法误用情况，且在内容表述上缺乏完整性。——“.....此外，这些方法还存在多种局限。此时，理论模拟与结构预测就显示了重要性。蛋白质结构预测问题就是如何从蛋白质的氨基酸序列出发预测它的功能构象问题。对蛋白质结构预测进行研究对基础理论和实际应用都有重大意义。在理论上，如果弄清二〇〇年六月十日星期四楚蛋白质级结构是如何决定其高级结构这个基本问题，将会使人们更系统和完整地理解生物信息从到具有生物活性蛋白质的传递全过程，使中心法则得到更完整的阐明，从而对生命过程中的各现象有进步的深刻认识，最终推动生命科学的快速发展。具体的讲，蛋白质结构预测的理论预测方法可分为三大类,同源建模法同源建模法比较建模法是基于知识的蛋白质结构预测方法......”。

7、以下这些语句存在标点错误、句法不清、语法失误和内容缺失等问题，需改进——“.....构象搜索算法，达到准确快速预测目的建立准确有效地判断蛋白质天然构象预测模型质量的方法。可见通过生物信息学的方法对蛋白质结构的预测，为进步研究蛋白质的生物学功能开辟了个新的领域。所谓的蛋白质结构预测就是如何从蛋白质的氨基酸序列预测出其空间结构。由于蛋白质的生物学功能在很大程度上依赖于其空间结构,因此进行蛋白质的结构预测对了解未知蛋白生物学功能具有重要意义。本课题即是通过计算机在系统下获得蛋白质基因的三维立体结构模型，进而讨论它在视觉周期中所发挥的重要作用。课题所介绍的计算机模型的研究，其主要过程是通过服务器获取基因蛋白的初步三维结构模型......”。

8、以下文段存在较多缺陷，具体而言：语法误用情况较多，标点符号使用不规范，影响文本断句理解；句子结构与表达缺乏流畅性，阅读体验受影响——“.....最后，应用与力场对初步模型进行修复和完善。根据获得的三维结构模型，对蛋白质功能的可能机制进行讨论。并了解该蛋白质的生物学功能，进而为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据，同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构。二〇〇年六月十日星期四第章背景介绍生物信息学在蛋白质结构预测中的应用目前，生物信息学主要是以计算机为工具对生物信息进行储存检索和分析，并从中归纳总结出生物系统的规律，是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之，同时也是世纪自然科学的核心领域之。其研究包括了基因组学蛋白质组学系统生物学比较基因组学，重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面......”。

9、以下这些语句存在多方面瑕疵，具体表现在：语法结构错误频现，标点符号运用失当，句子表达欠流畅，以及信息阐述不够周全，影响了整体的可读性和准确性——“.....分析序列中表达的结构功能的生物信息。自年在美国举办生物化学系统论与生物数学的计算机模型国际会议，生物信息学已经发展到了计算生物学计算系统生物学的时代。生物信息学的目标包括组织由实验中获取的大量有关生物学的数据即建立相应的数据库，如等方法学的研究建立分析这些数据的方法，如基因的确定，蛋白质结构预测等应用这些方法分析相关的数据，提取对生物学工作者尤其是实验工作者关心的生物学信息......”。