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图高原鼠兔和高原鼢鼠肠道菌群的组成图高原鼠兔和高原鼢鼠共有及特有的肠道菌群种类数为了探究高原鼠兔或高原鼢抗性基因对比微生物学论文。

数据处理使用软件版本分析的结果。

分析中不包括具有多个熔化峰或扩增效率在范围之外的样本。

对观察显著荧光信号所需的周期数阈值周期，进行了限制。

只有统计分析本研究所用的统计软件为。

用单因素方差分析比较两物种间主要肠道微生物相对丰度的差异以及种间多样性的差异用检验比较两物种间抗生素抗性基因，拷贝数的差异通过距离矩阵和距离矩阵比较两物种的多样性。

使用分析计算体重性别和物种对肠道微生物群落结构的影响使用冗余分析描述抗生素耐药基因与肠道微生物相对丰度的关系，并用秩相关系数判断抗生素抗性基因和肠道菌群的相关性，显著性水平。

表性基因和肠道微生物的关系表水平抗生素抗性基因和肠道微生物的关系讨论高原鼠兔和高原鼢鼠肠道微生物组成和多样性有差异高原鼠兔和高原鼢鼠肠道菌群的组成在门属和水平均有差异，这差异有可能是由者属于不同的物种，且膳食结构和生活环境不同造成的，因为宿主的种类膳食结构以及环境等因素都是肠道微生物结构的重要影响因素。

第，高原鼠兔属于鼠兔科而高原鼢鼠属于仓鼠科，者属于不同的物种。

第，高原鼠兔主要栖息在地上，以植物叶茎花根芽为食，较少摄入种子而高原鼢鼠主要栖息于地下，以植物根皮茎叶果实和种子为食，这两个物种的食物与生活的环境有差异。

物种饮食及生活环境的差异可能导致两物种肠道菌群的组成有差异。

在本次研究中，高原鼠兔和高原鼢鼠的多样性也有显著差异，高原鼠兔肠道菌群的多样性高于高原鼢鼠。

而肠道微生物往往因宿主基因型宿主生理状态宿主生活方式和宿主所处的环境因素等的改变而改变，两物种的基因型高原鼠兔和鼢鼠肠道微生物组及常见抗生素抗性基因对比微生物学论文距离矩阵比较两物种的多样性。

使用分析计算体重性别和物种对肠道微生物群落结构的影响使用冗余分析描述抗生素耐药基因与肠道微生物相对丰度的关系，并用秩相关系数判断抗生素抗性基因和肠道菌群的相关性，显著性水平。

表抗生素抗性基因的引物研究结果高原鼠兔和高原鼢鼠肠道微生物的组成本次研究鉴定到个门，个属，按的相似度聚类共筛选出个剔除只含有条序列的或不属于细菌的，在门水平和属水平分别选择相对丰度大于和的菌群作为优势门和优势属，用相对丰度描述肠道菌群的组成，其结果见图。

图是门水平高原鼠兔和高原鼢鼠肠道微生物的组成，其中主要的肠道微生物平均相对丰度有拟杆菌门，厚壁菌门，变形菌门，螺旋体门和放线菌门动物物种主要肠道菌群的差异。

在门水平，高原鼢鼠的拟杆菌门的平均相对丰度更高而高原鼠兔的厚壁菌门，放线菌门，疣微菌门和软壁菌门的平均相对丰度更高。

在属水平，高原鼢鼠的拟杆菌属和中属平均相对丰度高于高原鼠兔而高原鼠兔的普雷沃氏菌，颤螺菌属瘤球菌科属，拟杆菌目科属和丹毒科的平均相对丰度高于高原鼢鼠。

在水平，高原鼠兔的普雷沃氏菌，拟杆菌门，梭菌目，梭菌目，普雷沃氏菌，普雷沃氏菌，颤螺菌属，普雷沃氏菌，梭菌目维素的分解，能量的平衡以及免疫调节等功能，。

鉴于肠道菌群对动物健康的重要作用，它被认为是哺乳动物的个新器官，。

除了以上功能，肠道菌群在动物的适应性进化过程中也发挥了重要作用。

比如，青藏高原哺乳动物肠道微生物组进化出了很强的食物利用能力和纤维素降解活性，并且能够产生更多的短链脂肪酸，而短链脂肪酸是纤维素等多糖类物质经哺乳动物肠道微生物发酵产生的主要代谢产物，在宿主对营养物质的利用免疫调节脂质代谢和糖异生等生理功能中起着关键作用。

肠道微生物在具备众多功能的同时，也受到诸多因素的影响，比如膳食环境以及宿主的种类均能影响哺乳动物肠道菌群的组成，而肠道菌群组成的改变可以导致其功能发生变化，继而可能影响动物的生理和适应性。

生活在青藏高原的野生动物的肠道微生物样会受到这些因素的影响。

图，和分别代表了在门，属和水平两物种共有的和特有的微生物。

本次研究中，在门水平，仅出现在高原鼠兔中的有摘要高原鼠兔和高原鼢鼠是青藏高原的两种优势小型哺乳动物，其肠道微生物在宿主高原适应性方面发挥着重要作用，同时，作为野生动物，它们的肠道微生物也可能携带抗生素抗性基因并将其传播给人类，造成抗生素药物失效。

因此，对这两个物种肠道微生物组和抗生素抗性基因的研究十分重要。

本研究通过基因测序，定量等技术获得两物种肠道菌群特征并检测到了抗生素抗性基因。

结果发现，在门水平上，高原鼢鼠肠道拟杆菌门的相对丰度更高而高原鼠兔肠道厚壁菌门和放线菌门的相对丰度更高，在属水平上，高原鼢鼠的拟杆菌属和科中属的相对丰度更高，而高原鼠兔的普雷沃氏菌颤螺菌属和瘤球菌科中属的相对丰度更高。

这些微生物大多与植物多糖分解有关逸洁，苏军虎，李欢高原鼠兔和高原鼢鼠肠道微生物组及常见抗生素抗性基因的比较野生动物学报，。

材料与方法样品收集在青海泽库海拔，和果洛，用绳套法捕捉高原鼠兔，它们的平均体重为，雄性∶雌性为∶在甘肃临潭，和天祝用弓形夹捕捉高原鼢鼠，其平均体重为，雄性∶雌性为∶。

经兰州大学伦理委员会和动物保护协会批准后，对所有动物实施安乐死，即在野外用乙醚将动物麻醉致死并解剖动物，用无菌剪刀剪下盲肠，并立即用无菌镊子将肠道的内容物挤到无菌管中，所有样品均暂时冻存在便携式冰箱中，并于内运回实验室，在冰箱保存。

本次研究共收集高原鼠兔肠道内容物样本份和高原鼢鼠肠道内容物样本份。

根据之前我们的研究，高原鼠兔的食物主要有棘豆属毛茛属瘤果芹属马先蒿属和矮嵩草属也可以从外界环境中获得抗生素抗性基因，由于抗生素在畜牧业和养殖业中的长期滥用，在养殖动物肠道内诱导出可以编码抗生素抗性基因的抗性菌株，这些菌株随粪便排泄，再经雨水冲刷，地表径流和大气扩散等多种途径进入到环境中并被动物摄取，这些编码抗生素抗性基因的菌株是环境中抗生素抗性基因最重要的来源。

抗生素抗性基因可以通过质粒的水平交换从种细菌转移到人类或家畜微生物群，因此，高原鼠兔和高原鼢鼠体内的抗生素抗性基因可能源自以上两种途径。

肠道微生物和抗生素抗性基因的关系有研究发现，抗生素抗性基因普遍存在于农场动物的肠道微生物中，而高原鼠兔和高原鼢鼠与牦牛相互食粪的行为可能导致其肠道菌群中存在抗生素抗性基因。

动物微生物群中的耐药细菌因此可以作为抗生素抗性基因重要的贮存库。

而这些病原菌可以通过水平基因转移或交换质粒将抗生素抗性基因转移到肠道菌群中使肠道菌群携带抗生素抗性基因，有研究表明人类肠道中大量的微生如马驴梅花鹿的优势菌群。

甘肃鼢鼠又称罗氏鼢鼠，属于仓鼠科，鼢鼠属，是类长期生活在地下的杂食性动物，其食物往往是富含纤维素的植物根系，食性与高原鼢鼠相似马驴和梅花鹿均是常见的植食性动物，其食物富含纤维素。

因而，纤维素的消化吸收对以上几种动物而言尤为重要。

肠道中的厚壁菌门和拟杆菌门对动物消化食物中的纤维素有促进作用。

在属水平，类杆菌科的属普雷沃氏菌瘤胃球菌以及颤螺菌属是优势菌群，分布局限，主要存在于恒温动物的肠道内，且数量上在肠道菌群中占据主导地位，且中有多种细菌可以增加降解碳水化合物酶的相对含量。

高原鼢鼠和高原鼠兔均属于恒温动物，且它们的食物中富含纤维素等碳水化合物，因而平均相对丰度高。

普雷沃氏菌和瘤胃球菌均属于瘤胃纤维性分解菌，它们往往拥有不同的纤维素酶和半纤维素酶基因，帮助宿次研究共检测到类抗生素抗性基因，分别是环素类抗性基因，和磺胺类抗性基因和以及多重耐药基因，其中些抗生素抗性基因与部分菌群具有相关关系。

这些结果表明野生动物体内也存在抗生素抗性基因的蓄积，这些抗生素抗性基因可能传播给人类，对人类的健康产生危害，但可以通过调节野生动物肠道菌群来降低抗生素抗性基因的蓄积与传播。

关键词人类健康抗生素抗性基因肠道微生物高原鼠兔高原鼢鼠哺乳动物的胃肠道定植有数百种有益于健康的微生物。

通常这些动物的肠道在出生时是无菌的，但很快就会从母体饮食周围环境和其他个体中获得微生物。

肠道微生物群大约由数百到数千种微生物组成，并具有多种功能，包括多糖的消化，纤维素的分解，能量的平衡以及免疫调节等功能，。

鉴于肠道菌群对动物健康的重要作用，它被认为是哺乳动物的个新器官，。

除了以上功能，肠道菌群在动物的适应性进化过程中也发挥了重要作高原鼠兔和鼢鼠肠道微生物组及常见抗生素抗性基因对比微生物学论文植物而高原鼢鼠的食物主要有蔷薇科蕨麻，雪白委陵菜和禾本科披碱草植物。

肠道微生物和抗生素基因测定提取采用土壤基因组提取试剂盒，提取盲肠内容物总。

扩增使用通用引物和扩增微生物的基因，再使用含独特条形码的正向引物对每个产物进行标记。

用模板缓冲液氯化镁的脱氧核苷酸磷酸的引物，的大连和无菌水进行反应，每个样品做个重复。

热循环程序包括在下初始变性然后在下变性，下退火，下延长，共循环次最后在下延长。

高原鼠兔和鼢鼠肠道微生物组及常见抗生素抗性基因对比微生物学论文学报，张兴禄，李广高原鼠兔和高原鼢鼠在高寒草甸生态系统的作用草业科学，齐新章，王晓君，朱世海，等高原鼢鼠和高原鼠兔心脏对低氧环境的适应生理学报，徐冰洁，罗义，周启星，等抗生素抗性基因在环境中的来源传播扩散及生态风险环境化学，邹威，罗义，周启星畜禽粪便中抗生素抗性基因污染问题及环境调控农业环境科学学报，苏军虎徐长林，等甘南草原主要草食动物的食性及其生态位特征动物学杂志，孙笑非，王文娟，孙冬岩肠道微生物对宿主的适应性研究进展饲料研究杨静，南小宁，邹垚，等不同因素对盘山地区甘肃鼢鼠肠道细菌多样性的影响微生物学报，任世恩，南小宁，许淼，